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ソフトウェア

Rare Codon Analysis Protein Calculator (charge) PyMol (drawer)
Primer Tm (sigma-aldrich) BioEdit (seq analysis) DS Visualizer (drawer)
Clustal Omega (seq align) Clustal W/X (seq align) molmol (drawer)
QuikChange primer design BLAST (seq search) Agadir (helix prediction)
DISOPRED (IDP) NMRView (NMR analysis) PairCoil (coiled-coil 2mer)
PONDR (IDP) NMRPipe (NMR analysis) MultiCoil (coiled-coil n-mer)
POODLE (IDP) Contact order (Baker lab) FoldX (protein stability)
ESPRESSO (Solubility) Rosetta (Baker lab) Foldit (Baker lab)
SeqScanner (DNA sequencing) ATSAS (SAXS, EMBL) SAngler (SAXS, KEK-PF)
GLOVE (NMR R2 dispersion)


データベース

PubMed PDB (Protein Structure) DBGET (GenomeNET)
Web of Science SCOP (Protein Structure) DisProt (IDP)
Journal Citation Reports SCOPe (Protein Structure) Pfam (Protein family)
IS-Dom (Protein domain) CATH (Protein Structure)


雑誌

ScienceDirect Proc. Natl. Acad. Sci. USA Proteins
Nature J. Am. Chem. Soc. Protein Sci.
Science EMBO J. Protein Eng. Des. Sel.
Cell J. Mol. Biol. Structure
Mol. Cell J. Biol. Chem. Biophys. J.
Nature Struct. Mol. Biol. Biochemistry Biochem Biophys Res Comm
Nature Biotechnology FEBS Lett. J. Biochem.
Nature Chem. Biol. FEBS J. J. Biochem. (1922-2004)
Nature Communications Scientific Reports J. Biomol. NMR
PLoS ONE Biophysics and Physicobiology


学会等

Protein Society 日本生物物理学会 日本蛋白質科学会
Biophysical Society 日本生化学会 NMR討論会
日本生物工学会 日本物理学会 JST「藻類バイオエネルギー」
横浜NMR構造生物学研究会 構造エピゲノム研究会 PRC ニュースレター
新学術領域「運動マシナリー」 新学術領域「柔らかな分子系」 新学術領域「揺らぎと生体機能」
PEP TALK


研究者(敬称略)

Wright, P. E. (Scripps) 高橋 聡 (東北大) 笹井理生 (名古屋大)
Dyson, H. J. (Scripps) 後藤祐児 (大阪大) 本田真也 (産総研)
Matthews, C. R. (U Mass) 津本浩平 (東大) 槇 亙介 (名古屋大)
Bilsel, Osman (U Mass) 水口峰之 (富山大) 竹内 恒(産総研)
Baker, David (U Washington) 田口英樹 (東工大)


その他

Researchmap(研究者DB) UTask-Web(東大学内) 高エネ研 Photon Factory
J-GLOBAL(研究者・文献DB) UT-mate(東大学内) 高エネ研 共同利用支援システム
JREC-IN(研究者人材DB) UTCRIS(東大学内) e-Rad(研究費申請)
緊急地震速報(東大・地震研) SSL-VPN gateway(東大) 科研費(文部科学省)
東大駒場生協 MailSuite(東大) 科研費(日本学術振興会)
東大ポータル(学外から) 助成財団センター 駒場アラート