業績Papers (2010年4月以降)

Home > Papers

原著論文 |  総説  |  著書  |  博士論文 | 修士論文 | 卒業研究 | 
招待講演 | 口頭発表 | ポスター |  シンポ開催| その他  | 

原著論文


Furuki, T., Nobeyama, T., Suetaka, S., Matsui, R., Fukuoka, T., Arai, M., & Shiraki, K.
Reentrant condensation of a multicomponent cola/milk system induced by polyphosphate.
Food Chemistry: X 21, 101165 (2024) NEW!

Suzuki, T., Yoshimura, M., Arai, M., & Narikawa, R.
Crucial residue for tuning thermal relaxation kinetics in the biliverdin-binding cyanobacteriochrome photoreceptor revealed by site-saturation mutagenesis.
J Mol Biol. 436, 168451 (2024) NEW!

Ooka, K., & Arai, M.
Accurate prediction of protein folding mechanisms by simple structure-based statistical mechanical models.
Nature Communications 14, 6338 (2023)
[プレスリリース][UTokyo FOCUS 日本語][UTokyo FOCUS English][日経プレスリリース]
[日本経済新聞電子版(日経産業新聞印刷版)][生物物理学会][SciTechDaily][bNewTech]
[phys.org][Life Tecchnology][Knowledia][Scientific Frontline][newswise][My Droll]
[EurekAlert!][Swift Telecast]
[The 25 most downloaded Nature Communications articles in the life and biological sciences published in 2023にランクイン]

Suzuki, T., Yoshimura, M., Hoshino, H., Fushimi, K., Arai, M., & Narikawa, R.
Introduction of reversible cysteine ligation ability to the biliverdin-binding cyanobacteriochrome photoreceptor.
FEBS J. 290, 4999-5015 (2023)

Sato, N., Suetaka, S., Hayashi, Y., & Arai, M.
Rational peptide design for inhibition of the KIX-MLL interaction.
Scientific Reports 13, 6330 (2023)

Matsuike, D., Tahara, Y.O., Nonaka, T., Wu, H.N., Hamaguchi, T., Kudo, H., Hayashi, Y., Arai, M., & Miyata, M.
Structure and function of Gli123 involved in Mycoplasma mobile gliding.
J. Bacteriol. 205, e0034022 (2023)

Oka, Y., Yukawa, H., Kudo, H., Ooka, K., Wada, M., Suetaka, S., Chang, M., Kawai, H., Tanaka, R., Ichikawa, M., Suzuki, T., Hayashi, Y., Handa, A., & Arai, M.
A comparative study of unpasteurized and pasteurized frozen whole hen eggs using size-exclusion chromatography and small-angle X-ray scattering.
Scientific Reports 12, 9218 (2022)

Tashiro, D., Suetaka, S., Sato, N., Ooka, K., Kunihara, T., Kudo, H., Inatomi, J., Hayashi, Y., & Arai, M.
Intron-encoded domain of herstatin, an autoinhibitor of human epidermal growth factor receptors, is intrinsically disordered.
Frontiers in Molecular Biosciences 9, 862910 (2022)

Suetaka, S., Oka, Y., Kunihara, T., Hayashi, Y., & Arai, M.
Rational design of a helical peptide inhibitor targeting c-Myb-KIX interaction.
Scientific Reports 12, 816 (2022)
[プレスリリース][UTokyo FOCUS][日経プレスリリース]

Sato, Y., Matsugami, A., Watanabe, S., Hayashi, F., Arai, M., Kigawa, T., & Nishimura, C.
Changes in dynamic and static structures of the HIV-1 p24 capsid protein N-domain caused by amino-acid substitution are associated with its viral viability.
Protein Sci. 30(11), 2233-2245 (2021)

Shimizu, T., Hayashi, Y., Arai, M., McGlynn, S.E., Masuda, T., & Masuda, S.
Repressor activity of SqrR, a master regulator of persulfide-responsive genes, is regulated by heme coordination.
Plant Cell Physiology 62, 100-110 (2021)
[プレスリリース]

Yang, K., Arai, M., & Wright, P.E.
Determining binding kinetics of intrinsically disordered proteins by NMR spectroscopy.
Methods Mol. Biol. 2141, 663-681 (2020)

Chang, M., Shimba, K., Hayashi, Y., & Arai, M.
Electrostatic interactions are essential for binding of two enzymes in cyanobacterial alkane biosynthesis.
Biosci. Biotech. Biochem. 84(2), 228-237 (2020)

Kudo, H., Hayashi, Y., & Arai, M.
Improving hydrocarbon production by engineering cyanobacterial acyl-(acyl carrier protein) reductase.
Biotechnology for Biofuels 12, 291 (2019)
[プレスリリース][UTokyo FOCUS][日経プレスリリース][国立環境研究所 環境展望台]

Shimizu, T., Kacprzak, S.M., Mochizuki, N., Nagatani, A., Watanabe, S., Shimada, T., Tanaka, K., Hayashi, Y., Arai, M., Leister, D., Okamoto, H., Terry, M.J., & Masuda, T.
The retrograde signaling protein GUN1 regulates tetrapyrrole biosynthesis.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 116(49), 24900-24906 (2019)
[プレスリリース][UTokyo FOCUS] [日経プレスリリース][Eurek Alert!]

Kudo, H., Hayashi, Y., & Arai, M.
Identification of non-conserved residues essential for improving the hydrocarbon-producing activity of cyanobacterial aldehyde-deformylating oxygenase.
Biotechnology for Biofuels 12, 89 (2019)
[プレスリリース][UTokyo FOCUS] [日経プレスリリース][FISCO][国立環境研究所 環境展望台]
[日経産業新聞 2019年5月21日付]

Wada, M., Hayashi, Y., & Arai, M.
Mutational analysis of a catalytically important loop containing active site and substrate-binding site in Escherichia coli phytase AppA.
Biosci. Biotech. Biochem. 83(5), 860-868 (2019)

Kunihara, T., Hayashi, Y., & Arai, M.
Conformational diversity in the intrinsically disordered HIV-1 Tat protein induced by zinc and pH.
Biochem. Biophys. Res. Commun. 509(2), 564-569 (2019)

Kenri, T., Kawakita, Y., Kudo, H., Matsumoto, U., Mori, S., Furukawa, Y., Tahara, Y.O., Shibayama, K., Hayashi, Y., Arai, M., & Miyata, M.
Production and characterization of recombinant P1 adhesin essential for adhesion, gliding, and antigenic variation in the human pathogenic bacterium, Mycoplasma pneumoniae.
Biochem. Biophys. Res. Commun. 508(4), 1050-1055 (2019)

Kujirai, J., Nanba, S., Kadowaki, T., Oka, Y., Nishiyama, Y., Hayashi, Y., Arai, M., & Hihara, Y.
Interaction of the GntR-family transcription factor Sll1961 with thioredoxin in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803.
Scientific Reports 8, 6666 (2018)

Takenaka, T., Nakamura, T., Yanaka, S., Yagi-Utsumi, M., Chandak, M.S., Takahashi, K., Paul, S., Makabe, K., Arai, M., Kato, K., & Kuwajima, K.
Formation of the chaperonin complex studied by 2D NMR spectroscopy.
PLoS ONE 12(10), e0187022 (2017)

Otosu, T., Ishii, K., Oikawa, H., Arai, M., Takahashi, S., & Tahara, T.
Highly heterogeneous nature of the native and unfolded states of B domain of protein A revealed by two-dimensional fluorescence lifetime correlation spectroscopy.
J. Phys. Chem. B 121(22), 5463-5473 (2017)

Kudo, H., Nawa, R., Hayashi, Y., & Arai, M.
Comparison of aldehyde-producing activities of cyanobacterial acyl-(acyl carrier protein) reductases.
Biotechnology for Biofuels 9, 234 (2016)
[プレスリリース][UTokyo FOCUS (日本語)][UTokyo FOCUS (English)]
[日経プレスリリース][日経テクノロジー][日経バイオテク]
[日刊工業新聞 2016年11月3日付][国立環境研究所 環境展望台][Smart Japan]

Haberz, P., Arai, M., Martinez-Yamout, M.A., Dyson, H.J., & Wright, P.E.
Mapping the interactions of adenoviral E1A proteins with the p160 nuclear receptor coactivator binding domain of CBP.
Protein Sci. 25(12), 2256-2267 (2016)

Arai, M., Sugase, K., Dyson, H.J., & Wright, P.E.
Conformational propensities of intrinsically disordered proteins influence the mechanism of binding and folding.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112(31), 9614-9619 (2015)
[プレスリリース][UTokyo FOCUS (日本語)][UTokyo FOCUS (English)]
[日経プレスリリース][日経バイオテク]
[日経産業新聞 2015年7月31日付]

Oikawa, H., Kamagata, K., Arai, M., & Takahashi, S.
Complexity of the folding transition of the B domain of protein A revealed by the high-speed tracking of single-molecule fluorescence time series.
J. Phys. Chem. B 119(20), 6081-6091 (2015)

Hayashi, Y., Yasugi, F., & Arai, M.
Role of cysteine residues in the structure, stability, and alkane producing activity of cyanobacterial aldehyde deformylating oxygenase.
PLoS ONE 10(4), e0122217 (2015)

Ohori, Y., Okazaki, H., Watanabe, S., Tochio, N., Arai, M., Kigawa, T., & Nishimura, C.
Flexible and rigid structures in HIV-1 p17 matrix protein monitored by relaxation and amide proton exchange with NMR.
Biochim. Biophys. Acta 1844(3), 520-526 (2014)

Oikawa, H., Suzuki, Y., Saito, M., Kamagata, K., Arai, M., & Takahashi, S.
Microsecond dynamics of an unfolded protein by a line confocal tracking of single molecule fluorescence.
Scientific Reports 3, 2151 (2013)

Arai, M., Ferreon, J.C., & Wright, P.E.
Quantitative analysis of multisite protein ligand interactions by NMR: binding of intrinsically disordered p53 transactivation subdomains with the TAZ2 domain of CBP.
J. Am. Chem. Soc. 134(8), 3792-3803 (2012)

Arai, M., Iwakura, M., Matthews, C.R., & Bilsel, O.
Microsecond subdomain folding in dihydrofolate reductase.
J. Mol. Biol. 410(2), 329-342 (2011)

Arai, M., Dyson, H.J., & Wright, P.E.
Leu628 of the KIX domain of CBP is a key residue for the interaction with the MLL transactivation domain.
FEBS Lett. 584(22), 4500-4504 (2010)

Lee, C.W., Ferreon, J.C., Ferreon, A.C.M, Arai, M., & Wright, P.E.
Graded enhancement of p53 binding to CREB-binding protein (CBP) by multisite phosphorylation.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107(45), 19290-19295 (2010)
[featured article in UCSD-Nature Signaling Gateway


総説


大岡紘治、新井宗仁
タンパク質のフォールディング過程を正確に予測する方法
バイオサイエンスとインダストリー 82(3), 306-307 (2024) NEW!

Arai, M., Suetaka, S., Ooka, K.
Dynamics and interactions of intrinsically disordered proteins.
Current Opinion in Structural Biology 84, 102734 (2024)

新井宗仁
インフルエンザとCOVID-19の治療薬開発
総合診療 33(1), 87-89 (2023)

Hayashi, Y., Arai, M.
Recent advances in the improvement of cyanobacterial enzymes for bioalkane production.
Microbial Cell Factories 21, 256 (2022)

新井宗仁、申惠媛、大岡紘治
コロナ禍での「高校生と大学生のための金曜特別講座」
大学の物理教育 28(3), 164-168 (2022)

Ooka, K., Liu, R., Arai, M.
The Wako-Saito-Munoz-Eaton model for predicting protein folding and dynamics.
Molecules 27, 4460 (2022)

林勇樹、工藤恒、新井宗仁
ラン藻が持つアルカン合成関連酵素の高活性化
生物工学 99(9), 469-472 (2021)

工藤恒、林勇樹、新井宗仁
バイオ燃料生産に向けたラン藻由来アルカン合成酵素の高活性化
バイオサイエンスとインダストリー 78(4), 320-321 (2020)

工藤恒、林勇樹、新井宗仁
酵素の高機能化によるバイオ燃料の生産性の向上
クリーンエネルギー 29(5), 26-32 (2020)

Arai, M., Hayashi, Y., Kudo, H.
Cyanobacterial enzymes for bioalkane production
Adv. Exp. Med. Biol. 1080, 119-154 (2018)

Arai, M.
Unified understanding of folding and binding mechanisms of globular and intrinsically disordered proteins.
Biophysical Reviews 10(2), 163-181 (2018)

新井宗仁、林勇樹、工藤恒
ラン藻由来アルカン合成関連酵素の高活性化と軽油生産性の向上
月刊 ファインケミカル 46(2), 19-25 (2017)

日原由香子、朝山宗彦、蘆田弘樹、天尾豊、新井宗仁、粟井光一郎、得平茂樹、小山内崇、鞆達也、成川礼、蓮沼誠久、増川一
多彩な戦略で挑むシアノバクテリア由来の燃料生産 ― 持続可能な第三世代バイオ燃料生産の最前線
化学と生物 55(2), 88-97 (2017)

林勇樹
大腸菌の菌株の特徴を知ろう
生物工学 94(1), 15-20 (2016)

新井宗仁
NMRによるタンパク質-リガンド相互作用の定量解析法
生物物理 53(6), 305-308 (2013)


著書


新井宗仁
社会連携――「高校生と大学生のための金曜特別講座」
「駒場の70年 1949−2020 法人化以降の大学像を求めて」(東京大学教養学部 編)pp.317-319
東京大学出版会 ; 468頁 ; (2021/11/30)
ISBN: 9784130010900

林勇樹、工藤恒、新井宗仁
バイオ燃料生産に向けたラン藻由来アルカン生成酵素の高活性化
「バイオエネルギー再燃」(植田充美 監修)pp.100-108
シーエムシー出版 ; 289頁 ; (2021/11/10)
ISBN: 9784781316215

新井宗仁
タンパク質をデザインして産業や医療に応用する
「知のフィールドガイド 生命の根源を見つめる」(東京大学教養学部 編)pp.54-75
白水社 ; 188頁 ; (2020/05/14)
ISBN: 9784560097571

新井宗仁
高校生と大学生のための金曜特別講座――進路選択に悩む若者たちへ
「東京大学駒場スタイル」(東京大学教養学部 編)pp.44-45
東京大学出版会 ; 232頁 ; (2019/06/28)
ISBN: 9784130013512

新井宗仁
タンパク質の揺らぎと機能 〜結合と触媒〜
「揺らぎ・ダイナミクスと生体機能 〜物理化学的視点から見た生体分子〜」(寺嶋正秀 編)第17章 pp.267-280
化学同人 ; 350頁 ; (2013/09)
ISBN: 9784759815108


学位論文(博士)


佐藤那音
「タンパク質間相互作用を標的とした阻害剤の開発」
"Development of inhibitors targeting protein-protein interactions"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 博士課程・2023年度)

季高駿士
「αヘリックスを介したタンパク質間相互作用の阻害剤設計」
"Inhibitor Design of α-Helix-Mediated Protein-Protein Interactions"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 博士課程・2021年度)

大岡紘治
"Prediction of protein folding mechanisms by structure-based statistical mechanical models"
「構造ベースの統計力学モデルによるタンパク質のフォールディング機構の予測」
(大学院理学系研究科 物理学専攻 博士課程・2021年度)

鷹羽健一郎
"Edge expansion parallel cascade selection molecular dynamics simulation (eePaCS-MD) for investigating protein dynamics"
「エッジ拡張型並列カスケード選択分子動力学法(eePaCS-MD)を用いたタンパク質の動的構造探索」
(大学院理学系研究科 物理学専攻 博士課程・2020年度)

張マリ
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の物性解析」
"Analysis of physical properties of cyanobacterial enzymes for alkane biosynthesis"
(大学院理学系研究科 物理学専攻 博士課程・2019年度)

工藤恒
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の機能発現に重要なアミノ酸残基の同定」
"Idetification of amino acid residues essential for the fuction of cyanobacterial enzymes for alkane biosynthesis"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 博士課程・2018年度)

椢原朋子
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatの構造特性と分子認識」
"Structural properties and molecular recognition of an intrinsically disordered HIV-1 Tat protein"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 博士課程・2018年度)

和田愛未
"Improving cold-activity of phytase by empirical and rational design"
「経験的および合理的設計によるフィターゼの低温高活性化」
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 博士課程・2018年度)


学位論文(修士)


劉潤晶  一高記念賞受賞
「タンパク質のフォールディングと酵素反応の統計力学モデルによる予測」
"Predicting protein folding and enzyme reactions by statistical mechanical models"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2023年度)

小谷果穂
「酵素活性を合理的に向上させる理論的設計法の開発」
"Development of a theoretical design method for rational improvement of enzyme activity"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2023年度)

青山莉奈  広域科学専攻奨励賞受賞
「SARS-CoV-2変異株に対する中和抗体の合理的設計」
"Rational design of neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 variants"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2022年度)

島村博太郎
「免疫チェックポイント受容体PD-1に結合する小型タンパク質の合理的設計」
"Rational design of a small protein targeting the immune checkpoint receptor PD-1"
(大学院理学系研究科 物理学専攻 修士課程・2022年度)

寺西美月
「IL-33によるアレルギー疾患の抑制を目的とした新規タンパク質の理論的設計」
"Theoretical design of a novel protein for suppression of allergic diseases induced by interleukin-33"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2022年度)

大窪理仁
「液滴への酵素封じ込めによる二段階アルカン合成反応の効率化」
"Facilitating a two-step alkane synthesis reaction by enclosing two enzymes in droplets"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2022年度)

吉村匡隆  広域科学専攻奨励賞受賞
「合理的設計法による細胞内光遺伝学ツールMagnetの改良」
"Improving Magnets photodimerizers for subcellular optogenetics by computational design"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2021年度)

松本彩里
「SARS-CoV-2スパイクタンパク質の受容体結合ドメインに対する中和抗体の合理的設計」
"Rational design of neutralizing antibodies against the receptor-binding domain of the SARS-CoV-2 Spike protein"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2021年度)

益岡紫野
「分子動力学シミュレーションによるラン藻由来アルカン合成酵素の構造ダイナミクス解析」
"Structural dynamics analysis of a cyanobacterial alkane-producing enzyme by molecular dynamics simulations"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2021年度)

佐藤那音  広域科学専攻修士論文特別賞受賞
「転写コアクチベーターCBPのKIXドメインと転写アクチベーターとの相互作用を標的としたペプチド阻害剤の合理的設計」
"Rational design of the peptide inhibitor targeting the interaction of the KIX domain of the transcriptional coactivator CBP with transcriptional activators"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2020年度)

大原和久  広域科学専攻奨励賞受賞
「理論的飽和変異解析によるジヒドロ葉酸還元酵素の高活性化」
"Improving activity of dihydrofolate reductase by theoretical saturation mutagenesis"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2019年度)

佐野美桜
「アレルギー性喘息に関わるインターロイキン33の阻害剤開発に向けた研究」
"Studies toward the development of an interleukin-33 responsible for allergic asthma"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2019年度)

季高駿士  広域科学専攻修士論文特別賞受賞
「c-Myb-KIX間相互作用を阻害するペプチドの合理的設計」
"Rational design of a peptide inhibitor of the c-Myb-KIX interaction"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2018年度)

吉ア慧
「天然変性タンパク質c-Junの構造解析と転写コアクチベータCBPのKIXドメインとの相互作用」
"Structural analysis of the intrinsically disordered c-Jun protein and its interaction with the KIX domain of the transcriptional coactivator CBP"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2018年度)

大岡紘治
「統計力学モデルの拡張によるマルチドメインタンパク質のフォールディング機構の解析」
"Folding mechanisms of multi-domain proteins predicted by an extended statistical mechanical model"
(大学院理学系研究科 物理学専攻 修士課程・2018年度)

野村匡志  広域科学専攻奨励賞受賞
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の機能発現に重要なアミノ酸残基の探索」
"Search for amino acid residues essential for the function of a cyanobacterial enzyme for alkane biosynthesis"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2017年度)

末松佑麿  広域科学専攻奨励賞受賞
「NMRと分子動力学シミュレーションによるアルカン合成酵素のダイナミクス解析」
"Structural dynamics of an alkane synthase studied by NMR and molecular dynamics simulations"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2017年度)

野辺卓郎
「NMRによるジヒドロ葉酸還元酵素の高活性型変異体の構造ダイナミクス解析」
"Structural dynamics of the highly active mutant of dihydrofolate reductase studied by NMR"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2017年度)

河合秀信  広域科学専攻奨励賞受賞
「天然タンパク質の立体構造物性に関する統計解析」
"Statistical analysis on the structural properties of native proteins"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2016年度)

岡芳樹
「合理的設計による抗体精製用アフィニティーリガンドの抗体解離pHの制御」
"Rational design of an affinity ligand for antibody purification to control the pH-sensitive antibody dissociation"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2016年度)

榛葉啓悟
「ラン藻由来アルカン合成酵素の網羅的アラニンスキャン変異解析」
"Comprehensive alanine-scanning mutagenesis of the cyanobacterial alkane synthase"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2016年度)

張マリ
「ラン藻でのアルカン合成に必要な2つの酵素間の結合部位の探索」
"Search for the binding sites between two enzymes essential for cyanobacterial alkane biosynthesis"
(大学院理学系研究科 物理学専攻 修士課程・2016年度)

工藤 恒  広域科学専攻奨励賞受賞
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の構造機能解析とバイオエネルギー生産への応用」
"Structural and functional analysis of cyanobacterial enzymes for alkane biosynthesis and its application for bioenergy production"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2015年度)

椢原朋子
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatの立体構造解析」
"Structural analysis of the intrinsically disordered HIV-1 Tat protein"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2015年度)

田代大祐
「HERファミリー阻害剤ハースタチンのC末端ドメインの立体構造解析」
"Structural analysis of the C-terminal domain of Herstatin, a HER family inhibitor"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2015年度)

稲富純一
「マイコプラズマGli349タンパク質の立体構造解析」
"Structural analysis of the gliding protein Gli349 from Mycoplasma mobile"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2014年度)

澤田泰平
「穏やかなpHで抗体精製するための新規アフィニティーリガンドの開発」
"Development of a novel affinity ligand for purification of antibodies at moderate pH"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2014年度)

八杉文隆
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の変異解析」
"Mutational analysis of the cyanobacterial enzyme for alkane biosynthesis"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2014年度)

高橋大輔
「天然タンパク質の分子サイズ特性に関する理論的解析」
"Theoretical analysis of the molecular size of native proteins"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2013年度)

袖山浩平
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatによる標的分子認識機構」
"Mechanism of target recognition by HIV-1 Tat, an intrinsically disordered protein"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2012年度)

渡辺尚大
「抗体精製用新規アフィニティーリガンドの設計」
"Design of a novel affinity ligand for antibody purification"
(大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 修士課程・2012年度)


卒業研究(学士)


岡田隼弥
「シアノバクテリア由来のアルカン合成酵素の理論的高活性化」
(教養学部 統合自然科学科・2023年度)

井上慎也
「PD-1/PD-L1相互作用を阻害するタンパク質の合理的設計」
(教養学部 統合自然科学科・2022年度)

劉潤晶
「統計力学モデルの改良によるタンパク質のフォールディング反応経路の予測」
(教養学部 統合自然科学科・2021年度)

磯田正覚
「アルカン合成酵素の高活性化変異体の合理的設計」
(教養学部 統合自然科学科・2021年度)

寺西美月
「IL33-ST2のPPI阻害剤の理論的設計と実験的検証」
(教養学部 統合自然科学科・2020年度)

吉村匡隆
「Magnetのタンパク質間相互作用を強化する変異体の合理的設計」
(教養学部 統合自然科学科・2019年度)

吉ア慧  統合自然科学科長賞受賞
「天然変性タンパク質c-Junの構造解析と転写コアクチベータCBPのKIXドメインとの相互作用の解析」
(教養学部 統合自然科学科・2016年度)

季高駿士
「c-Myb-KIX間相互作用を阻害するペプチドの合理的設計」
(教養学部 統合自然科学科・2016年度)

末松佑麿
「アルカン合成酵素ADのNMRとMDによるダイナミクス解析」
(教養学部 統合自然科学科・2015年度)

野村芳弘
「Gli349タンパク質のドメイン境界探索と立体構造解析」
(教養学部 統合自然科学科・2015年度)

河合秀信
「天然タンパク質の分子サイズ特性に関する統計解析」
(教養学部 統合自然科学科・2014年度)

名和良太
「様々なアルカン産生シアノバクテリアに由来するアシルACP還元酵素の活性比較」
(教養学部 基礎科学科・2013年度)

八杉文隆
「アルカン合成関連酵素ADのアラニンスキャン変異解析」
(教養学部 基礎科学科・2012年度)

灘広至郎
「アルカン合成関連酵素AARのアラニンスキャン変異解析」
(教養学部 基礎科学科・2012年度)


招待・依頼講演


新井宗仁
「タンパク質複合体における相互作用のFMO解析」
第19回FMODD全体会議・FMODD 10周年記念シンポジウム
2024年5月9日(木)大阪大学(大阪市北区)

新井宗仁、大岡紘治、劉潤晶、加藤沙愛、長井駿
「タンパク質の構造ダイナミクスを予測可能とする物理学理論の開発」
日本農芸化学会2024年度大会
2024年3月25日(月)東京農業大学(東京都世田谷区)

新井宗仁
「有用タンパク質の合理的設計に向けて」
高分子進化工学 第2回公開シンポジウム
2024年3月22日(金)東京大学教養学部(東京都目黒区)

新井宗仁
「タンパク質のフォールディングとデザイン」
第12回デジタルバイオ研究会
2024年3月19日(火)東京大学工学部(東京都文京区)

佐藤那音
「タンパク質間相互作用を標的とした阻害剤の開発」
先進基礎科学推進国際卓越大学院教育プログラムWINGS-ABC 第1回公開コロキウム
2024年3月8日(金)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁
「タンパク質のフォールディングとデザインの理論的研究〜酵素の合理的高活性化を目指して〜」
学術変革領域研究(A)「予知生合成科学」第3回公開シンポジウム
2024年2月16日(金)東京大学理学部(東京都文京区)

新井宗仁
「タンパク質のフォールディングとデザイン」
京都大学大学院理学研究科化学専攻 学術講演会
2023年12月20日(水)京都大学理学部(京都府京都市)

Arai, M.
"Accurate prediction of protein folding mechanisms by simple statistical mechanical models"
21st KIAS Conference on Protein Structure and Function
2023年10月13日(金)Korea Institute for Advanced Study, Seoul, Korea

新井宗仁
「タンパク質のフォールディングとデザイン研究の新展開」
生物物理若手の会 夏の学校
2023年9月6日(水)オンライン

新井宗仁
「酵素反応の予知と酵素活性の向上を可能とする物理学ベースの理論的手法の開発」
学術変革領域研究(A)「予知生合成科学」第2回公開シンポジウム
2023年6月10日(土)北海道大学薬学部(北海道札幌市)

新井宗仁
「機能性タンパク質の理論的設計」
物性研短期研究会「理論タンパク質物性科学の最前線:理論と実験との密な協働」
2022年7月26日(火)東京大学物性研究所(千葉県柏市)

新井宗仁
「タンパク質の立体構造予測ツールAlphaFold 2を使って何ができるのか」
ラン藻ゲノム交流会2022
2022年7月2日(金)東京都立大学(東京都八王子市)

新井宗仁
「『高校生と大学生のための金曜特別講座』――大学から高校生へのオンライン教育」
東京大学大学院総合文化研究科・教養学部附属教養教育高度化機構主催シンポジウム「大学における社会連携による教育の可能性」
2022年3月15日(火)オンライン開催

新井宗仁
「タンパク質分子機能の合理的設計」
日本化学会 第101春季年会 中長期テーマシンポジウム「次世代分子システムが拓く未来の化学―協奏的機能連動」
2021年3月19日(金)オンライン開催

新井宗仁
「NMRによるタンパク質間相互作用の解析」
次世代NMRワークショップ
2021年3月16日(火)オンライン開催

新井宗仁
そしゃかふぇ『劇アカさんを連れてきた。』
2021年2月9日(火)東京大学(オンライン開催)

新井宗仁
「抗ウイルス薬の設計法」
東京都立小石川中等教育学校サイエンスカフェ
2020年12月21日(月)東京都立小石川中等教育学校(東京都文京区)

新井宗仁
「『金曜特別講座』――高校生と大学生に向けた進路選択のための教育」
次世代育成教育フォーラム
2020年11月28日(土)オンライン配信

新井宗仁
「ウイルス感染を阻害するタンパク質の理論的設計」
東京都生物教育研究会
2020年10月10日(土)東京都立浅草高等学校(東京都台東区)

Arai, M.
"Theoretical approaches to protein folding and design"(英語)
第58回日本生物物理学会年会シンポジウム "Biophysical studies on protein folding/misfolding and aggregation with regard to life sciences"
2020年9月17日(木) オンライン配信

新井宗仁
「ウイルス感染のメカニズムと薬の開発法」
東京大学教養学部主催「高校生と大学生のための金曜特別講座」
2020年5月8日(金)オンライン配信

新井宗仁
「機能性タンパク質システムの理論的デザインに向けて」
日本化学会第100春季年会 中長期テーマシンポジウム「次世代分子システムが拓く未来の化学」
2020年3月24日(火)東京理科大学(千葉県野田市)

新井宗仁
「タンパク質をデザインする」
駒場サイエンス倶楽部
2019年10月2日(月)東京大学(東京都目黒区)

Arai, M.
"Toward the development of GTP biosensors"
The 5th International GTP Workshop
2019年9月29日(日)職員会館かもがわ(京都府京都市)

Oka, Y., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of high-affinity ATP biosensors"
The 5th International GTP Workshop
2019年9月29日(日)職員会館かもがわ(京都府京都市)

Arai, M.
"Rational design of binding proteins for PPI inhibition and antibody purification"
19th KIAS Conference on Protein Structure and Function
2019年9月27日(金)Korea Institute for Advanced Study, Seoul, Korea

新井宗仁
「理論と実験によるタンパク質デザイン」
第71回日本生物工学会大会シンポジウム「タンパク質工学におけるドライ−ウェット技術融合の新展開」
2019年9月17日(火)岡山大学(岡山県岡山市)

工藤恒、張マリ、大岡紘治、季高駿士、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の高活性化に重要な非保存部位の探索」
第19回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「天然物生合成の構造生物学と合成生物学の協奏」
2019年6月24日(月)神戸国際会議場(兵庫県神戸市)

新井宗仁
「教授としゃべランチ 〜タンパク質についてしゃべランチ〜」
2019年5月22日(水)東京大学(東京都目黒区)

工藤恒
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の機能発現に重要なアミノ酸残基の同定」
静岡大学理学部セミナー
2019年4月5日(金)静岡大学静岡キャンパス(静岡県静岡市)

Arai, M.
"Experimental and theoretical design of enzymes and binding proteins"(英語)
分子研研究会「New Frontier in Protein Design & Engineering」
2019年3月16日(土)分子科学研究所(愛知県岡崎市)

新井宗仁
「タンパク質をデザインする」
駒場サイエンス倶楽部
2018年7月9日(月)東京大学(東京都目黒区)

工藤恒
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素群の活性に重要なアミノ酸部位の同定」
ラン藻ゲノム交流会2018
2018年6月30日(土)東京大学(東京都目黒区)

Arai, M.
"Current and future perspectives of protein design"(英語)
第18回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「蛋白工学の過去・現在・未来:1983年からの35周年を記念して」
2018年6月26日(火)朱鷺メッセ(新潟県新潟市)

岡芳樹、竹内恒、林勇樹、新井宗仁
「細胞内GTP定量センサーの開発」
第4回KEK-筑波大連携セミナー「生命の機能とかたち」
2018年3月7日(水)筑波大学(茨城県つくば市)

岡芳樹、竹内恒、林勇樹、新井宗仁
「細胞内GTP定量センサーの開発」
2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)ワークショップ「 多角的解析からみえてくるGTPの新たな機能と人疾患への治療戦略」
2017年12月9日(土)神戸ポートピアホテル(兵庫県神戸市)

新井宗仁
「教授としゃべランチ 〜統合生命科学についてしゃべランチ〜」
2017年6月27日(火)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁
「分子動力学シミュレーションによるラン藻由来アルカン合成酵素の構造ダイナミクス解析」
ラン藻ゲノム交流会2017
2017年6月24日(土)東京大学(東京都目黒区)

季高駿士、岡芳樹 、林勇樹 、新井宗仁
「c-Myb-KIX 間相互作用を阻害するペプチドの合理的設計」
第17回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「タンパク質科学における理論と実験の協奏」
2017年6月22日(木)仙台国際センター(宮城県仙台市)

吉崎慧、末松佑麿、季高駿士、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質c-Jun と転写コアクチベータCBP のKIX ドメインの相互作用」
第17回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「天然変性領域及びマルチサブユニット複合体の機能解析」
2017年6月22日(木)仙台国際センター(宮城県仙台市)

新井宗仁
「タンパク質をデザインして産業や医療に応用する」
東京大学教養学部主催「高校生と大学生のための金曜特別講座」
2017年6月16日(金)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁
「天然変性タンパク質を利用した創薬基盤技術の開発」
第6回岐阜構造生物学・医学・論理的創薬研究会シンポジウム
2017年3月14日(火)岐阜薬科大学(岐阜県岐阜市)

河合秀信、高橋大輔、新井宗仁
"Statistical analysis on the molecular size of native proteins"(英語)
第54回日本生物物理学会年会・シンポジウム「Frontiers in protein organization and disorganization」
2016年11月26日(土)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

新井宗仁
「教授としゃべランチ」
2016年10月19日(水)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁
「バイオエネルギーをつくる」
東京大学教養学部統合自然科学科 駒場サイエンス倶楽部
2016年5月20日(金)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁
「タンパク質のフォールディングとデザイン」
東京大学 大学院理学系研究科 物理学専攻 A7サブコース 第3回シンポジウム「生物物理の新展開」
2016年5月20日(金)東京大学(東京都文京区)

新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の高活性化」
JST「藻類バイオエネルギー」研究領域 公開シンポジウム
2014年12月4日(木)NSスカイカンフェレンス(東京都新宿区)

新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の網羅的変異解析」
ラン藻ゲノム交流会2014
2014年7月19日(土)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁
「タンパク質の構造ダイナミクスと機能デザイン」
大阪市立大学理学部生物学科セミナー
2014年7月17日(木)大阪市立大学(大阪府大阪市)

新井宗仁
「NMRによるタンパク質-リガンド相互作用の定量解析法」
第14回日本蛋白質科学会年会・ワークショップ「解離定数とストイキオメトリーを考えた分子間相互作用解析」
2014年6月26日(木)ワークピア横浜(神奈川県横浜市)

新井宗仁
「生命のプログラムを解く」
東京大学 大学院理学系研究科 物理学専攻 A7サブコース 第1回シンポジウム「生物物理の新展開」
2014年4月25日(金)東京大学(東京都文京区)

新井宗仁
「タンパク質のコンホメーションとその異常 − 食物アレルギーとの関係」
東京大学教養学部統合自然科学科 駒場サイエンス倶楽部
2013年12月17日(火)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁
「NMRによるタンパク質-リガンド相互作用の定量解析法」
第14回若手NMR研究会
2013年6月29日(土)京都トラベラーズ・イン(京都府京都市)

林勇樹
「進化分子工学の新展開」
第8回理研「バイオものづくり」シンポジウム
2013年3月8日(金)理化学研究所(埼玉県和光市)

Arai, M.
"Molecular recognition by intrinsically disordered proteins"(英語)
International Symposium on Protein Folding and its Biological Significance
2013年3月4日(月)岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)

新井宗仁
「研究者になるためには」
群馬県立高崎女子高等学校SSH講演会(女性科学セミナー)
2012年12月7日(金)群馬県立高崎女子高等学校(群馬県高崎市)

新井宗仁
「蛋白質デザインが医療と産業を変える」
群馬県立高崎女子高等学校SSH講演会(学年講演会)
2012年11月1日(木)群馬県立高崎女子高等学校(群馬県高崎市)

新井宗仁
「天然変性タンパク質による標的分子認識機構」
新学術領域「揺らぎと生体機能・水和とATP」合同公開シンポジウム「ゆらぎと水 - 生命のエネルギーと機能の分子機構を探る」
2012年9月15日(土)大阪ガーデンパレス(大阪府大阪市)

Arai, M.
"Molecular recognition by intrinsically disordered proteins"(英語)
4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences Experiments and Simulations
2012年1月9日(月)東大寺総合文化センター(奈良県奈良市)

新井宗仁
「天然変性蛋白質による分子認識」
東京工業大学大学院生命理工学研究科生体分子機能工学専攻セミナー
2011年12月1日(木)東京工業大学(神奈川県横浜市)

新井宗仁
「蛋白質による標的分子認識のメカニズム」
公開シンポジウム「蛋白質の機能を解き明かす多彩なアプローチ」
2011年10月17日(月)横浜市立大学(神奈川県横浜市)

新井宗仁
"Tackling the protein fluctuation problem by systematic amino acid substitutions"(英語)
日本生物物理学会第49回年会・シンポジウム「生命分子の揺らぎを探る新たなアプローチ」
2011年9月17日(土)兵庫県立大学(兵庫県姫路市)

新井宗仁
「天然変性蛋白質による分子認識」
東京大学教養学部基礎科学科談話会
2010年9月7日(火)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁
「天然変性蛋白質のフォールディングと分子認識機構」
第10回日本蛋白質科学会年会・ワークショップ「蛋白質のフォールディング研究が拓く新しい生命科学」
2010年6月17日(木)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

新井宗仁
「天然変性蛋白質のフォールディングと分子認識」
名古屋大学理学部物理学教室談話会
2010年6月8日(火)名古屋大学(愛知県名古屋市)


口頭発表


Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Computational and experimental studies of hot spots in the c-Myb-KIX interaction"
CBI学会2022年大会
2022年10月27日(木)タワーホール船堀(東京都江戸川区)

吉村匡隆、青野侑基、林勇樹、佐藤守俊、新井宗仁
「理論的設計法による細胞内光遺伝学ツールMagnetの改良」
第22回日本蛋白質科学会年会
2022年6月7日(火)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

劉潤晶、大岡紘治、新井宗仁
「統計力学モデルの改良によるタンパク質のフォールディング反応経路の予測」
第22回日本蛋白質科学会年会
2022年6月7日(火)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Suetaka, S.(学生発表賞受賞), Sato, N., Honda, E., Takashima, H., Oka, Y., Kunihara, T., Takehara, D., Yoshimori, A., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational drug design to inhibit α-helix-mediated protein-protein interactions"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月26日(金)オンライン開催

Ooka, K.(学生発表賞受賞), Arai, M.
"Prediction of folding mechanisms of disulfide-containing proteins by the extended statistical mechanical model and the kinetic model"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月26日(金)オンライン開催

Sato, N., Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of the peptide inhibitor targeting the interactions involved in transcriptional activation"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月26日(金)オンライン開催

Yoshimura, M., Aono, Y., Hayashi, Y., Sato, M., Arai, M.
"Improving dimer affinity of Magnets photodimerizers by computational design"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月26日(金)オンライン開催

Matsumoto, S., Hayashi, Y., Arai, M. "Rational design of neutralizing antibodies against the receptor-binding domain of SARS-CoV-2 Spike protein"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月26日(金)オンライン開催

Teranishi, M., Sano, M., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of an interleukin-33/ST2 inhibitor for suppressing allergic asthma"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月26日(金)オンライン開催

Shimamura, H., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of immune checkpoint binding proteins targeting the PD-1 receptor"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月26日(金)オンライン開催

Liu, R., Ooka, K., Arai, M.
"Improving the statistical mechanical model of protein folding by accurate contact calculation"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月26日(金)オンライン開催

Okubo, R., Hayashi, Y., Arai, M.
"Facilitating a two-step enzymatic reaction by trapping two enzymes in light-inducible droplets"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月25日(木)オンライン開催

Aoyama, R., Matsumoto, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Theoretical design of neutralizing antibodies that are effective for SARS-CoV-2 variants"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月25日(木)オンライン開催

Isoda, M., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of highly active mutants of an alkane-producing enzyme"(英語)
第59回日本生物物理学会年会
2021年11月25日(木)オンライン開催

Takashima, H., Yoshimori, A., Honda, E., Taguri, T., Ozawa, J., Shuto, S., Suetaka, S., Sato, N., Hayashi, Y., Arai, M., Takehara, D.
"Visualized and Quantitative Structural Analysis of Peptidomimetics for PPI Drug Discovery"
CBI学会2021年大会
2021年10月25日(月)オンライン開催

寺西美月、林勇樹、新井宗仁
「IL33-ST2のPPI阻害剤の論理的設計と実験的検証」
第10回日本生物物理学会関東支部会
2021年3月2日(火)オンライン開催

季高駿士、林勇樹、新井宗仁
「実験的手法と理論的手法によるc-Myb−KIX間相互作用に重要なアミノ酸残基の特定同定」
第10回日本生物物理学会関東支部会
2021年3月2日(火)オンライン開催

大岡紘治、新井宗仁
「統計力学モデルの拡張によるタンパク質のフォールディング機構の解析」
第10回日本生物物理学会関東支部会
2021年3月2日(火)オンライン開催

佐藤那音、季高駿士、林勇樹、新井宗仁
「転写コアクチベーターCBPのKIXドメインと転写アクチベーターとの相互作用を標的としたPPI阻害剤の合理的設計」
第10回日本生物物理学会関東支部会
2021年3月2日(火)オンライン開催

佐藤那音
「転写コアクチベーターCBPのKIXドメインと転写アクチベーターとの相互作用を標的としたペプチド阻害剤の合理的設計」
2020年度 卓越コロキウム
2021年2月9日(火)東京大学(オンライン開催)

佐野美桜、岡芳樹、林勇樹、新井宗仁
「アレルギー性喘息に関わるインターロイキン33阻害剤の開発に向けて」
第9回日本生物物理学会関東支部会
2020年3月2日(月)理化学研究所 和光研究所(埼玉県和光市)

林勇樹、新井宗仁
「細胞内発光を利用したハイスループットスクリーニングにより得られた高活性変異体アシルACP還元酵素の評価」
第71回日本生物工学会大会
2019年9月16日(月)岡山大学(岡山県岡山市)

和田愛未、林勇樹、新井宗仁
「進化分子工学による大腸菌フィターゼAppAの低温高活性化」
日本農芸化学会2019年度大会
2019年3月27日(水)東京農業大学(東京都世田谷区)

大岡紘治、新井宗仁
「統計力学モデルの拡張によるジスルフィド結合含有タンパク質のフォールディング機構の解析」
第8回日本生物物理学会関東支部会
2019年3月4日(月)青山学院大学(神奈川県相模原市)

季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
「c-Myb-KIX間相互作用を阻害するペプチドの合理的設計」
第8回日本生物物理学会関東支部会
2019年3月4日(月)青山学院大学(神奈川県相模原市)

工藤恒、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の活性向上に重要なアミノ酸残基の同定」
第8回日本生物物理学会関東支部会
2019年3月4日(月)青山学院大学(神奈川県相模原市)

季高駿士
「タンパク質間相互作用を阻害するペプチドの理論的設計」
平成30年度 卓越コロキウム
2019年2月14日(木)東京大学(東京都目黒区)

Ooka, K.(学生発表賞受賞), Arai, M.
"Prediction of folding mechanisms of multi-domain proteins by an extended statistical mechanical model"
第56回日本生物物理学会年会
2018年9月15-17日(土〜月)岡山大学(岡山県岡山市)

Yoshizaki, S., Suematsu, Y., Suetaka, S., Kunihara, T., Hayashi, Y., and Arai, M.
"Structural analysis of the intrinsically disordered c-Jun and its interaction with the KIX domain of the transcriptional coactivator CBP"
第56回日本生物物理学会年会
2018年9月15-17日(土〜月)岡山大学(岡山県岡山市)

Suetaka, S., Oka, Y., Kunihara, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of peptides that inhibit interaction of the transcription factor c-Myb with the KIX domain of CBP"
第56回日本生物物理学会年会
2018年9月15-17日(土〜月)岡山大学(岡山県岡山市)

Kudo, H., Hayashi, Y., Arai, M.
"Identification of amino acid residues essential for hydrocarbon production in aldehyde deformylating oxygenase from cyanobacteria"
第56回日本生物物理学会年会
2018年9月15-17日(土〜月)岡山大学(岡山県岡山市)

工藤恒、林勇樹、新井宗仁
「変異解析によるラン藻由来アルカン合成関連酵素の機能発現に重要な部位の同定」
第70回日本生物工学会大会
2018年9月5日(水)〜7日(金)関西大学(大阪府吹田市)

林勇樹、新井宗仁
「細胞内酵素活性の可視化を利用したアシルACP還元酵素の高活性変異体のハイスループットスクリーニング」
第70回日本生物工学会大会
2018年9月5日(水)〜7日(金)関西大学(大阪府吹田市)

和田愛未、林勇樹、新井宗仁
「リン酸化合物加水分解酵素フィターゼの活性に重要なループ領域の変異解析」
第70回日本生物工学会大会
2018年9月5日(水)〜7日(金)関西大学(大阪府吹田市)

工藤恒、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アシルACP還元酵素の変異解析による炭化水素合成量の向上」
日本農芸化学会2018年度大会
2018年3月17日(土)名城大学(愛知県名古屋市)

和田愛未、林勇樹、新井宗仁
「進化分子工学によるフィチン酸加水分解酵素の低温活性向上」
日本農芸化学会2018年度大会
2018年3月17日(土)名城大学(愛知県名古屋市)

工藤恒、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アシルACP還元酵素の変異解析による炭化水素合成量の向上」
第7回日本生物物理学会関東支部会
2018年3月14日(水)東京大学(東京都目黒区)

椢原朋子、林勇樹、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatの構造特性と分子認識」
第7回日本生物物理学会関東支部会
2018年3月13日(火)東京大学(東京都目黒区)

岡芳樹、竹内恒、林勇樹、新井宗仁
「細胞内GTP定量センサーの開発」
第7回日本生物物理学会関東支部会
2018年3月13日(火)東京大学(東京都目黒区)

大岡紘治、新井宗仁
「統計力学モデルによるジスルフィド結合含有タンパク質のフォールディング機構の解析」
第7回日本生物物理学会関東支部会
2018年3月13日(火)東京大学(東京都目黒区)

岡芳樹、澤田泰平、渡辺尚大、工藤恒、和田愛未、河合秀信、張マリ、林勇樹、新井宗仁
「中性に近いpHで抗体を精製可能な新規アフィニティーカラムの開発」
2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
2017年12月9日(土)神戸商工会議所(兵庫県神戸市)

Kudo, H., Hayashi, Y., Arai, M.
"Improving activity and solubility of cyanobacterial enzymes for hydrocarbon biosynthesis"(英語)
第55回日本生物物理学会年会
2017年9月19日(火)熊本大学(熊本県熊本市)

Oka, Y., Sawada, T., Watanabe, T., Kudo, H., Wada, M., Kawai, H., Chang, M., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of a novel affinity ligand for antibody purification by controlling the pH-sensitive antibody interaction"(英語)
第55回日本生物物理学会年会
2017年9月19日(火)熊本大学(熊本県熊本市)

新井宗仁
「天然変性タンパク質による標的分子認識機構」
第18回若手NMR研究会
2017年9月4日(月)かんぽの宿紀伊田辺(和歌山県田辺市)

工藤恒、名和良太、榛葉啓悟、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の機能解析」
第6回日本生物物理学会関東支部会
2017年3月13日(月)早稲田大学先端生命医科学センター(東京都新宿区)

和田愛未、林勇樹、新井宗仁
「進化分子工学によるフィチン酸塩加水分解酵素の活性向上」
第6回日本生物物理学会関東支部会
2017年3月13日(月)早稲田大学先端生命医科学センター(東京都新宿区)

岡芳樹、澤田泰平、渡辺尚大、工藤恒、和田愛未、河合秀信、張マリ、林勇樹、新井宗仁
「合理的設計による抗体精製用アフィニティーリガンドFPAの改良」
第6回日本生物物理学会関東支部会
2017年3月13日(月)早稲田大学先端生命医科学センター(東京都新宿区)

河合秀信
「天然タンパク質の立体構造物性に関する統計解析」
卓越コロキウム2017
2017年2月15日(水)東京大学(東京都目黒区)

岡芳樹
「合理的設計による抗体精製用アフィニティーリガンドの抗体解離pHの制御」
卓越コロキウム2017
2017年2月15日(水)東京大学(東京都目黒区)

林勇樹
「マイコプラズマ滑走タンパク質の構造ダイナミクス解析」
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第4回全体会議
2016年6月8日(水)長崎大学(長崎県長崎市)

鯨井 純一、門脇太朗、新井宗仁、久堀徹、日原由香子
「シアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803における転写因子Sll1961とチオレドキシンとの相互作用解析」
第57回日本植物生理学会年会
2016年3月19日(土)岩手大学(岩手県盛岡市)

工藤恒、名和良太、林勇樹、渡辺麻衣、池内昌彦、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の構造機能解析とバイオエネルギー生産への応用」
第5回日本生物物理学会関東支部会
2016年3月11日(金)桐生地域地場産業振興センター(群馬県桐生市)

岡芳樹、澤田泰平、渡辺尚大、林勇樹、新井宗仁
「合理的設計による抗体精製用リガンドFPAの開発」
第5回日本生物物理学会関東支部会
2016年3月11日(金)桐生地域地場産業振興センター(群馬県桐生市)

和田愛未、野村芳弘、林勇樹,、稲富純一、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、宮田真人、新井宗仁
「マイコプラズマGli49タンパク質の立体構造解析」
第5回日本生物物理学会関東支部会
2016年3月11日(金)桐生地域地場産業振興センター(群馬県桐生市)

河合秀信、高橋大輔、新井宗仁
「天然タンパク質の立体構造物性に関する統計解析」
第5回日本生物物理学会関東支部会
2016年3月10日(木)桐生地域地場産業振興センター(群馬県桐生市)

椢原朋子、林勇樹、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatの立体構造解析」
第5回日本生物物理学会関東支部会
2016年3月10日(木)桐生地域地場産業振興センター(群馬県桐生市)

張マリ、榛葉啓悟、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻でのアルカン合成に必要な2つの酵素間の結合部位の探索」
第5回日本生物物理学会関東支部会
2016年3月10日(木)桐生地域地場産業振興センター(群馬県桐生市)

末松佑麿
「計算機シミュレーションによるタンパク質解析」
統合自然科学科 学生発表会
2016年3月2日(水)東京大学(東京都目黒区)

椢原朋子
「ヒト免疫不全ウイルス由来タンパク質Tatの立体構造解析」
卓越コロキウム2016
2016年2月17日(水)東京大学(東京都目黒区)

工藤恒
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の構造機能解析とバイオエネルギー生産への応用」
卓越コロキウム2016
2016年2月17日(水)東京大学(東京都目黒区)

Oikawa, H., Kamagata, K., Arai, M., Takahashi, S.
"Complex folding transition of the B domain of protein A investigated by the high-speed measurement of single-molecule FRET time series"(英語)
Pacifichem 2015
2015年12月15日(火)Honolulu, Hawaii, USA

工藤恒
「シアノバクテリア由来アルカン合成関連酵素の機能解析」
日本生物工学会東日本支部 第10回 学生発表討論会
2015年11月13日(金)八王子セミナーハウス(東京都八王子市)

工藤恒、名和良太、林勇樹、渡辺麻衣、池内昌彦、新井宗仁
「シアノバクテリア由来アルカン合成関連酵素の機能解析及びバイオエネルギー生産への応用」
光合成若手&植物脂質若手ジョイントセミナー2015
2015年10月10日(土)東京大学(東京都文京区)

Kudo, H., Nawa, R., Hayashi, Y., Mai Watanabe, Ikeuchi, M., Arai, M.
"Functional analysis of the cyanobacterial enzyme for alkane biosynthesis and its application for bioenergy production"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月14日(月)金沢大学(石川県金沢市)

Kunihara, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"pH-dependent conformational changes in the intrinsically disordered HIV-1 Tat protein"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月14日(月)金沢大学(石川県金沢市)

Oikawa, H., Arai, M., Fukasawa, A., Yokota, H., Ide, T., Takahashi, S.
"Tracking microsecond single-molecule FRET dynamics on the fast protein folding by the line-confocal microscopy"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月14日(月)金沢大学(石川県金沢市)

新井宗仁
「マイコプラズマ滑走タンパク質の構造ダイナミクス解析」
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第3回全体会議
2015年6月10日(水)金沢商工会議所会館(石川県金沢市)

椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatによる標的分子認識機構」
第4回日本生物物理学会関東支部会
2015年3月10日(火)日本大学(東京都世田谷区)

工藤 恒、池内昌彦、新井宗仁
「シアノバクテリア由来アルカン合成酵素の変異解析及びバイオエネルギー産生への応用」
第4回日本生物物理学会関東支部会
2015年3月10日(火)日本大学(東京都世田谷区)

新井宗仁
「マイコプラズマGli349タンパク質の構造ダイナミクス解析」
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第2回全体会議
2014年6月16日(月)旭川大雪クリスタルホール(北海道旭川市)

新井宗仁
「マイコプラズマGli349タンパク質の構造ダイナミクス解析」
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第1回全体会議
2013年6月28日(金)名古屋大学(愛知県名古屋市)

新井宗仁、渡辺尚大、八杉文隆、灘広至郎
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の高活性化」
第64回日本生物工学会大会
2012年10月24日(水)神戸国際会議場(兵庫県神戸市)

Hayashi, Y., Jumpei Morimoto, Hiroaki Suga
"Exploring cyclic peptide inhibitors against the Akt2 kinase by the RaPID system"(英語)
第50回日本生物物理学会年会
2012年9月22日(土)名古屋大学(愛知県名古屋市)

新井宗仁
「天然変性蛋白質の分子認識と揺らぎ制御」
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」平成24年度合同班会議
2012年7月30日(月)作並温泉 一の坊(宮城県仙台市)

新井宗仁, Ferreon, J.C., Wright, P.E.
「天然変性タンパク質p53による標的タンパク質CBPの分子認識」
生物物理関東地区研究会
2012年3月5日(月)東京農工大学(東京都小金井市)

Arai, M., Masahiro Iwakura, C. Robert Matthews, Osman Bilsel
「Microsecond subdomain folding in dihydrofolate reductase」(英語)
日本生物物理学会第49回年会
2011年9月17日(土)兵庫県立大学(兵庫県姫路市)

新井宗仁
「ミュータノーム解析に基づく天然変性蛋白質の揺らぎ制御」
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」平成23年度合同班会議
2011年6月27日(月)ゆうばりホテルシューパロ(北海道夕張市)

Arai, M., Ferreon, J.C., Dyson, H.J., Wright, P.E.
「NMRによる天然変性蛋白質p53の転写活性化サブドメインとCBP TAZ2との相互作用解析」(英語)
日本生物物理学会第48回年会
2010年9月22日(水)東北大学(宮城県仙台市)

新井宗仁
「網羅的アミノ酸置換データベースに基づく蛋白質の揺らぎ制御」
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」平成22年度合同班会議
2010年6月28日(月)加賀観光ホテル(石川県加賀市)


ポスター発表


吉村匡隆、新井宗仁
「FMOとMD計算による細胞内光遺伝学ツールMagnets変異体のPPI解析」
第19回FMODD全体会議・FMODD 10周年記念シンポジウム
2024年5月9日(木)大阪大学(大阪市北区)

Ooka, K., Arai, M.
"Development of statistical mechanical models that can predict folding mechanisms of any protein"(英語)
第61回日本生物物理学会年会
2023年11月16日(木)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

Suetaka, S., Yoshimura, M., Ooka, K., Arai, M.
"Prediction of nascent chain folding of large multidomain proteins by AlphaFold2"(英語)
第61回日本生物物理学会年会
2023年11月16日(木)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

Kato, S., Ooka, K., Liu, R., Arai, M.
"Theoretical design of protein folding pathways by a statistical mechanical model"(英語)
第61回日本生物物理学会年会
2023年11月15日(水)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

Nagai, S., Ooka, K., Liu, R., Arai, M.
"Predicting mechanisms of mutual synergistic folding by a statistical mechanical model"(英語)
第61回日本生物物理学会年会
2023年11月15日(水)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

Inoue, S., Suetaka, S., Arai, M.
"Theoretical design of a small PD-1 antagonist with deep learning"(英語)
第61回日本生物物理学会年会
2023年11月15日(水)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

Liu, R., Ooka, K., Arai, M.
"Predicting free energy landscapes of enzyme reactions by an extended statistical mechanical model"(英語)
第61回日本生物物理学会年会
2023年11月14日(火)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

Yoshimura, M., Oda, S., Arai, M.
"Molecular dynamics simulations of substrate binding and product dissociation dynamics of a cyanobacterial alkane synthase"(英語)
第61回日本生物物理学会年会
2023年11月14日(火)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

季高駿士、吉村匡隆、大岡紘治、新井宗仁
「Nascent protein folding predicted by AlphaFold2」
第23回日本蛋白質科学会年会
2023年7月7日(金)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

佐藤那音(ポスター賞受賞)、季高駿士、新井宗仁
「合理的なリンカー設計による二価型キメラペプチド阻害剤の開発」
第23回日本蛋白質科学会年会
2023年7月6日(木)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

劉潤晶、大岡紘治、新井宗仁
「改良型統計力学モデルによるall-β型タンパク質のフォールディング反応経路の予測」
第23回日本蛋白質科学会年会
2023年7月6日(木)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

小谷果穂、大原和久、季高駿士、林勇樹、新井宗仁
「酵素活性を合理的に向上させる理論的設計法の開発」
第23回日本蛋白質科学会年会
2023年7月6日(木)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

古木智大、延山知弘、季高駿士、新井宗仁、白木賢太郎
「ポリリン酸が引き起こす多成分複合系のリエントラント凝縮」
第23回日本蛋白質科学会年会
2023年7月6日(木)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

大岡紘治、新井宗仁
「大きさや形の異なる様々なタンパク質のフォールディング機構を予測可能な統計力学モデル」
第23回日本蛋白質科学会年会
2023年7月5日(水)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

吉村匡隆、新井宗仁
「MDとフラグメント分子軌道(FMO)計算による細胞内光遺伝学ツールMagnetsの相互作用解析」
第23回日本蛋白質科学会年会
2023年7月5日(水)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

大岡紘治、劉潤晶、新井宗仁
「統計力学理論に基づくタンパク質の構造ダイナミクスの予測」
学術変革領域研究(A)「予知生合成科学」第2回公開シンポジウム
2023年6月10日(土)北海道大学薬学部(北海道札幌市)

新井宗仁
「酵素反応の予知と酵素活性の向上を可能とする物理学ベースの理論的手法の開発」
学術変革領域研究(A)「予知生合成科学」第2回公開シンポジウム
2023年6月10日(土)北海道大学薬学部(北海道札幌市)

Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Identifying key residues of c-Myb-KIX interaction by alanine scanning mutagenesis"(英語)
第60回日本生物物理学会年会
2022年9月30日(金)函館アリーナ(北海道函館市)

Sato, N. (学生発表賞受賞), Suetaka, S., Honda, E., Takashima, H., Takehara, D., Yoshimori, A., Hayashi, Y., Arai, M.
"Search for helix-mimetic compounds that inhibit protein-protein interactions"(英語)
第60回日本生物物理学会年会
2022年9月29日(木)函館アリーナ(北海道函館市)

Yoshimura, M. (学生発表賞受賞), Aono, Y., Hayashi, Y., Kawano, F., Sato, M., Arai, M.
"Comparison and further improvement of the intracellular optogenetic tool Magnets variants"(英語)
第60回日本生物物理学会年会
2022年9月29日(木)函館アリーナ(北海道函館市)

Aoyama, R., Matsumoto, S., Sato, N., Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Development of neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 variants by rational design"(英語)
第60回日本生物物理学会年会
2022年9月29日(木)函館アリーナ(北海道函館市)

Teranishi, M., Sato, N., Suetaka, S., Sano, M., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of proteins that can inhibit allergic diseases"(英語)
第60回日本生物物理学会年会
2022年9月29日(木)函館アリーナ(北海道函館市)

Ooka, K., Arai, M.
"Folding mechanisms of apomyoglobin predicted by an extended statistical mechanical model"(英語)
第60回日本生物物理学会年会
2022年9月29日(木)函館アリーナ(北海道函館市)

Liu, R., Ooka, K., Arai, M.
"Predicting protein folding pathways using the statistical mechanical model modified with accurate contact calculation"(英語)
第60回日本生物物理学会年会
2022年9月29日(木)函館アリーナ(北海道函館市)

Shimamura, H., Shunji Shuetaka, Sato, N., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of PD-1 binding proteins to develop PD-1 agonists"(英語)
第60回日本生物物理学会年会
2022年9月28日(水)函館アリーナ(北海道函館市)

季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
「c-Myb-KIX間相互作用を阻害するヘリカルペプチドの合理的設計」
CBI学会2021年大会
2021年10月25日(月)〜10月26日(火) オンライン開催

Honda, E., Takashima, H., Takehara, D., Yoshimori, A., Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Structural Peptidomimetics (2): PPIs Hit Discovery Using PepMetics Library"
ACS Fall 2021
2021年8月22日(日)〜8月26日(木) オンライン開催

Ooka, K.(ポスター賞受賞), Arai, M.
"Prediction of folding mechanisms of lysozyme and α-lactalbumin by an extended statistical mechanical model"
第21回日本蛋白質科学会年会
2021年6月17日(木)オンライン開催

Sato, N., Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of the peptide inhibitor targeting the interaction of the KIX domain of the transcriptional coactivator CBP with transcriptional activators"
第21回日本蛋白質科学会年会
2021年6月17日(木)オンライン開催

Teranishi, M., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of inhibitors targeting the interaction between interleukin-33 and its receptor ST2"
第21回日本蛋白質科学会年会
2021年6月17日(木)オンライン開催

Suetaka, S., Hayashi, Y., Honda, E., Takashima, H., Arai, M.
"Discovery of helix mimetic inhibitors targeting the interactions between the transcriptional activators and coactivator"
第21回日本蛋白質科学会年会
2021年6月16日(水)オンライン開催

Hayashi, Y., Arai, M.
"High-throughput screening of acyl-ACP reductase using the activity-dependent E. coli luminescence and evaluation of highly active mutants"
第21回日本蛋白質科学会年会
2021年6月16日(水)オンライン開催

Ooka, K.(学生発表賞受賞), Arai, M.
"Protein folding mechanisms predicted by an extended statistical mechanical model"(英語)
第58回日本生物物理学会年会
2020年9月16-18日 オンライン開催

Suetaka, S.(学生発表賞受賞), Oka, Y., Kunihara, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of an alpha-helical peptide to inhibit c-Myb-KIX interaction"(英語)
第58回日本生物物理学会年会
2020年9月16-18日 オンライン開催

Sato, N.(学生発表賞受賞), Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of the peptide inhibitor targeting the KIX domain of CBP and transcriptional activators interaction"(英語)
第58回日本生物物理学会年会
2020年9月16-18日 オンライン開催

Sato, H., Kodama, A.,Kudo, H., Ooka, K., Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M., Miyata, M.
"Structural analysis of MMOB1620 which composes Mycoplasma mobile's motor"(英語)
第58回日本生物物理学会年会
2020年9月16-18日 オンライン開催

Suetaka, S., Oka, Y., Kunihara, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of small proteins that inhibit a transcriptional activator-coactivator interaction"(英語)
第20回日本蛋白質科学会年会
2020年7月 オンライン開催

Sato, N., Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of an inhibitor for the interaction of the KIX domain of CBP with transcriptional activators"(英語)
第20回日本蛋白質科学会年会
2020年7月 オンライン開催

Ooka, K., Arai, M.
"Prediction of folding pathways of multi-domain proteins by an extended statistical mechanical model"(英語)
第20回日本蛋白質科学会年会
2020年7月 オンライン開催

佐藤宏樹、工藤恒、児玉彩、大岡紘治、季高駿士、林勇樹、新井宗仁、宮田真人
「Mycoplasma mobile が持つモーターを構成する機能未知タンパク質、MMOB1620 の構造」
第93回日本細菌学会総会
2020年2月19日(水)ウインクあいち(愛知県名古屋市)

Suetaka, S.(学生発表賞受賞), Oka, Y., Kunihara, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"Computational design of a peptide inhibitor targeting c-Myb-KIX interaction"
第57回日本生物物理学会年会
2019年9月25日(水)シーガイアコンベンションセンター(宮崎県宮崎市)

Ohara, K., Oka, Y., Hayashi, Y., Arai, M.
"Improving activity of dihydrofolate reductase by theoretical saturation mutagenesis"
第57回日本生物物理学会年会
2019年9月25日(水)シーガイアコンベンションセンター(宮崎県宮崎市)

Sato, H., Kodama, A.,Kudo, H., Ooka, K., Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M., Miyata, M.
"Structural analysis of MMOB1620 which composes Mycoplasma mobile's motor"
第57回日本生物物理学会年会
2019年9月25日(水)シーガイアコンベンションセンター(宮崎県宮崎市)

Ooka, K.(学生発表賞受賞), Arai, M.
"Prediction of protein folding mechanisms by an extended statistical mechanical model"
第57回日本生物物理学会年会
2019年9月24日(火)シーガイアコンベンションセンター(宮崎県宮崎市)

Sano, M., Oka, Y., Hayashi, Y., Arai, M.
"Toward the development of an inhibitor of interleukin-33 responsible for allergic asthma"
第57回日本生物物理学会年会
2019年9月24日(火)シーガイアコンベンションセンター(宮崎県宮崎市)

Sato, N., Suetaka, S., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of peptides that inhibit interactions between the KIX domain of CBP and transcription factors"
第57回日本生物物理学会年会
2019年9月24日(火)シーガイアコンベンションセンター(宮崎県宮崎市)

Kudo, H., Hayashi, Y., Arai, M.
"Identification of the residues that are responsible for improving the activities of cyanobacterial enzymes for hydrocarbon biosynthesis"
Enzyme Engineering XXV 2019年9月15-19日(日−木)Whistler Resort (British Columbia, Canada)

大岡紘治(ポスター賞受賞)、新井宗仁
「統計力学モデルの拡張によるリゾチームとα-ラクトアルブミンのフォールディング反応機構の解析」
第19回日本蛋白質科学会年会
2019年6月25日(火)神戸国際会議場(兵庫県神戸市)

季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
「c-Myb-KIX間相互作用を標的としたペプチド阻害剤の合理的設計」
第19回日本蛋白質科学会年会
2019年6月25日(火)神戸国際会議場(兵庫県神戸市)

林勇樹、新井宗仁
「細胞内酵素活性に応じて発光する大腸菌を利用したアシル-ACP還元酵素の高活性変異体の創出」
第19回日本蛋白質科学会年会
2019年6月24日(月)神戸国際会議場(兵庫県神戸市)

工藤恒、張マリ、大岡紘治、季高駿士、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の高活性化に重要な非保存部位の探索」
第19回日本蛋白質科学会年会
2019年6月24日(月)神戸国際会議場(兵庫県神戸市)

張マリ、榛葉啓悟、工藤恒、季高駿士、大岡紘治、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
「アルカン合成関連酵素間の結合に必要な静電相互作用」
第19回日本蛋白質科学会年会
2019年6月24日(月)神戸国際会議場(兵庫県神戸市)

Matsuike, D., Yuhei O Tahara, Hamaguchi, T., Arai, M., Miyata, M.
"Two different conformations of Gli123 protein, essential for Mycoplasma mobile gliding"
第92回日本細菌学会総会
2019年4月23日(火)-25日(木)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

工藤恒、林勇樹、新井宗仁
「アルカン合成関連酵素の高活性化に重要な非保存部位の同定」
第19回 東京大学生命科学シンポジウム
2019年4月20日(土)東京大学(東京都文京区)

季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
「タンパク質間相互作用を阻害しうるペプチドの合理的設計」
第19回 東京大学生命科学シンポジウム
2019年4月20日(土)東京大学(東京都文京区)

大岡紘治、新井宗仁
「統計力学モデルによるタンパク質のフォールディング反応機構の予測」
第19回 東京大学生命科学シンポジウム
2019年4月20日(土)東京大学(東京都文京区)

難波理、鯨井純一、門脇太朗、岡芳樹、林勇樹、新井宗仁、園池公毅、日原由香子
「シアノバクテリア Synechocystis sp. PCC 6803 におけるGntR型転写因子Sll1961の機能解析: 2. 遺伝子の発現制御」
第13回ゲノム微生物学会年会
2019年3月9日(土)首都大学東京(東京都八王子市)

張マリ(学術優秀賞受賞)、榛葉啓悟、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻でのアルカン合成に必要な2つの酵素間の相互作用」
在日韓国科学技術者協会 第10回合同分科会
2019年2月23日(土)韓国中央会館(東京都港区)

Oka, Y., Suetaka, S., Hinako Ago, Yuna Miyachi, Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of nucleotide sensors for intracellular quantitative imaging"
第56回日本生物物理学会年会
2018年9月17日(月)岡山大学(岡山県岡山市)

Sano, M., Oka, Y., Hayashi, Y., Arai, M.
"Development of a protein that inhibits interleukin-33 responsible for allergic asthma"
第56回日本生物物理学会年会
2018年9月17日(月)岡山大学(岡山県岡山市)

Ohara, K., Oka, Y., Hayashi, Y., Arai, M.
"Enhancing activity of dihydrofolate reductase by theoretical mutational analysis"
第56回日本生物物理学会年会
2018年9月17日(月)岡山大学(岡山県岡山市)

Matsuike, D., Yuhei O Tahara, Hamaguchi, T., Arai, M., Miyata, M.
"Structural analyses of Gli123 protein, essential for Mycoplasma mobile gliding"
22nd Congress of the International Organization for Mycoplasmology
2018年7月9-12日,Portsmouth, New Hampshire USA

椢原朋子、林勇樹、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatの構造特性と分子認識」
第18回日本蛋白質科学会年会
2018年6月26日(火)朱鷺メッセ(新潟県新潟市)

大岡紘治、新井宗仁
「統計力学モデルの拡張によるジスルフィド結合含有タンパク質のフォールディング反応機構の解析」
第18回日本蛋白質科学会年会
2018年6月26日(火)朱鷺メッセ(新潟県新潟市)

岡芳樹、澤田泰平、渡辺尚大、工藤恒、和田愛未、河合秀信、張マリ、林勇樹、新井宗仁
「中性に近いpHで抗体を精製可能な新規アフィニティーカラムの開発」
2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
2017年12月8日(金)神戸国際展示場(兵庫県神戸市)

工藤恒、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来炭化水素合成関連酵素の機能に重要なアミノ酸部位の探索」
藍藻の分子生物学2017
2017年12月1日(金)かずさアカデミアパーク(千葉県木更津市)

Ooka, K., Arai, M.
"Folding pathways of multi-domain proteins predicted by a statistical mechanical model"(英語)
第55回日本生物物理学会年会
2017年9月21日(木)熊本大学(熊本県熊本市)

Hayashi, Y., Arai, M.
"In vivo real-time measurement of fatty aldehyde and its application"(英語)
第55回日本生物物理学会年会
2017年9月21日(木)熊本大学(熊本県熊本市)

Chang, M., Shimba, K., Kudo, H., Kawai, H., Oka, Y., Wada, M., Hayashi, Y., Arai, M.
"Interaction between two enzymes essential for cyanobacterial alkane biosynthesis"(英語)
第55回日本生物物理学会年会
2017年9月21日(木)熊本大学(熊本県熊本市)

Takaba, K., Kitao, A.
"Nontargeted parallel cascade selection molecular dynamics using convex hull for structure selection"(英語)
第55回日本生物物理学会年会
2017年9月21日(木)熊本大学(熊本県熊本市)

Nomura, M., Kudo, H., Hayashi, Y., Arai, M.
"Mutational analysis of amino acid residues important for the function of an enzyme for alkane biosynthesis"(英語)
第55回日本生物物理学会年会
2017年9月19日(火)熊本大学(熊本県熊本市)

Hayashi, Y., Inatomi, J., Nomura, Y., Wada, M., Kudo, H., Kawai, H., Oka, Y., Kawakita, Y., Yabe, M., Hamaguchi, T., Takamori, A., Miyata, M., & Arai, M.
"Structural analysis of the gliding protein Gli349 from Mycoplasma mobile by domain fragmentation"
International Symposium on "Harmonized supramolecular motility machinery and its diversity"
2017年9月13日(水)名古屋大学(愛知県名古屋市)

Matsuike, D., Tahara, Y.O., Hamaguchi, T., Arai, M., & Miyata, M.
"Structural analyses of Gli123 protein, essential for Mycoplasma mobile gliding"
International Symposium on "Harmonized supramolecular motility machinery and its diversity"
2017年9月13日(水)名古屋大学(愛知県名古屋市)

林勇樹、新井宗仁
「細胞内酵素活性の可視化によるアシルACP還元酵素の進化分子工学」
第69回日本生物工学会大会
2017年9月13日(水)早稲田大学(東京都新宿区)

新井宗仁
「天然変性蛋白質による標的分子認識機構の解明」
2017旭硝子財団 助成研究発表会
2017年7月27日(木)ホテルグランドヒル市ヶ谷(東京都新宿区)

河合秀信、新井宗仁
「天然タンパク質の慣性半径・球形度・密度についての統計解析」
第17回日本蛋白質科学会年会
2017年6月22日(木)仙台国際センター(宮城県仙台市)

工藤恒、名和良太、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素群の機能解析」
第17回日本蛋白質科学会年会
2017年6月21日(水)仙台国際センター(宮城県仙台市)

椢原朋子、林勇樹、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatの亜鉛とpHに依存した構造多様性」
第17回日本蛋白質科学会年会
2017年6月21日(水)仙台国際センター(宮城県仙台市)

吉崎慧、末松佑麿、季高駿士、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質c-Junと転写コアクチベータCBPのKIXドメインの相互作用」
第17回日本蛋白質科学会年会
2017年6月21日(水)仙台国際センター(宮城県仙台市)

和田愛未、林勇樹、新井宗仁
「進化分子工学によるフィチン酸塩加水分解酵素の活性向上」
第17回日本蛋白質科学会年会
2017年6月20日(火)仙台国際センター(宮城県仙台市)

岡芳樹(ポスター賞受賞)、澤田泰平、渡辺尚大、工藤恒、和田愛未、河合秀信、張マリ、林勇樹、新井宗仁
「合理的設計による新規抗体精製用アフィニティーリガンドの開発」
第17回日本蛋白質科学会年会
2017年6月20日(火)仙台国際センター(宮城県仙台市)

張マリ、榛葉啓悟、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻でのアルカン合成に必要な2つの酵素間の相互作用」
第17回日本蛋白質科学会年会
2017年6月20日(火)仙台国際センター(宮城県仙台市)

季高駿士、岡芳樹、林勇樹、新井宗仁
「c-Myb-KIX間相互作用を阻害するペプチドの合理的設計」
第17回日本蛋白質科学会年会
2017年6月20日(火)仙台国際センター(宮城県仙台市)

Matsuike, D., Tahara, Y.O., Hamaguchi, T., Arai, M., Miyata, M.
"Structural analyses of the Gli123 protein, essential for Mycoplasma mobile gliding"(英語)
第8回OCARINA(複合先端研究機構)国際シンポジウム
2017年3月7日 大阪市立大学(大阪府大阪市)

Wada, M.(学生発表賞受賞), Hayashi, Y., Arai, M.
"Improving activity of a phytate-hydrolyzing enzyme by directed evolution"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月25日(金)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Kudo, H.(学生発表賞受賞), Nawa, R., Hayashi, Y., Arai, M.
"Structural and functional analysis of a cyanobacterial enzyme for alkane biosynthesis"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月26日(土)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Hayashi, Y., Nomura, Y., Wada, M., Hamaguchi, T., Takamori, A., Miyata, M., Arai, M.
"Determination of domain boundaries and analysis of domain structures of the gliding protein Gli349 from Mycoplasma mobile"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月26日(土)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Nomura, M., Kudo, H., Hayashi, Y., Arai, M.
"Alanine scanning mutagenesis reveals functional roles of conserved residues in an enzyme for alkane biosynthesis"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月26日(土)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Nobe, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"NMR analysis of structural fluctuation of a highly active mutant of Escherichia coli dihydrofolate reductase"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月26日(土)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Suetaka, S., Oka, Y., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of a peptide inhibitor of the c-Myb-KIX interaction"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月26日(土)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Kawai, H.(学生発表賞受賞), Takahashi, D., Arai, M.
"Statistical analysis on the structural properties of native proteins"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月25日(金)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Suematsu, Y.(学生発表賞受賞), Kamatari, Y.O., Hayashi, Y., Arai, M.
"Structural dynamics of a cyanobacterial alkane synthase studied by NMR and molecular dynamics simulations"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月25日(金)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Oka, Y., Sawada, T., Watanabe, T., Kudo, H., Wada, M., Kawai, H., Chang, M., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design of FPA, a ligand for antibody purification"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月25日(金)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Chang, M., Shimba, K., Hayashi, Y., Arai, M.
"Search for the binding sites between two enzymes essential for cyanobacterial alkane biosynthesis"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月25日(金)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Kunihara, T., Hayashi, Y., Kudo, H., Kawai, H., Oka, Y., Arai, M.
"Conformational diversity in the intrinsically disordered HIV-1 Tat protein induced by zinc and pH"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月25日(金)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Shimba, K., Yasugi, F., Hayashi, Y., Arai, M.
"Alanine scanning mutagenesis of a cyanobacterial alkane synthase"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月25日(金)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

Yoshizaki, S., Kunihara, T., Hayashi, Y., and Arai, M.
"Interaction of the intrinsically disordered c-Jun with the KIX domain of the transcriptional coactivator CBP"(英語)
第54回日本生物物理学会年会
2016年11月25日(金)つくば国際会議場(茨城県つくば市)

工藤恒、名和良太、林勇樹、渡辺麻衣、池内昌彦、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素を利用したバイオエネルギー生産」
酵素工学研究会 第76回講演会
2016年10月7日(金)東京大学(東京都文京区)

林勇樹、新井宗仁
「脂肪酸アシルACP還元酵素のin vivo迅速活性評価法の開発」
第68回日本生物工学会年次大会
2016年9月30日(金)富山国際会議場(富山県富山市)

河合秀信、高橋大輔、新井宗仁
「天然タンパク質の立体構造物性に関する統計解析」
第56回生物物理若手の会 夏の学校
2016年9月2日(金)〜4日(日)支笏湖ユースホステル(北海道千歳市)

岡芳樹、澤田泰平、渡辺尚大、林勇樹、新井宗仁
「合理的設計による抗体精製用リガンドFPAの開発」
第56回生物物理若手の会 夏の学校
2016年9月2日(金)〜4日(日)支笏湖ユースホステル(北海道千歳市)

工藤恒、名和良太、林勇樹、新井宗仁
「石油をたくさん作る酵素の創製」
第56回生物物理若手の会 夏の学校
2016年9月2日(金)〜4日(日)支笏湖ユースホステル(北海道千歳市)

Arai, M., Sugase, K., Dyson, H.J., Wright, P.E.
"Conformational propensities of intrinsically disordered proteins influence the mechanism of binding and folding"
ICMRBS2016 (27th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems)
2016年8月25日(木)京都国際会館(京都府京都市)

Kunihara, T., Hayashi, Y., Kudo, H., Kawai, H., Oka, Y., Arai, M.
"Structural analysis of the intrinsically disordered HIV-1 Tat protein"
ICMRBS2016 (27th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems)
2016年8月23日(火)京都国際会館(京都府京都市)

和田愛未、野村芳弘、林勇樹、稲富純一、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、宮田真人、新井宗仁
「マイコプラズマGli349タンパク質の立体構造解析」
第16回日本蛋白質科学会年会
2016年6月9日(木)福岡国際会議場(福岡県福岡市)

岡芳樹、澤田泰平、渡辺尚大、林勇樹、新井宗仁
「合理的設計による抗体精製用リガンドFPAの開発」
第16回日本蛋白質科学会年会
2016年6月8日(水)福岡国際会議場(福岡県福岡市)

張マリ、榛葉啓悟、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻でのアルカン合成に必要な2つの酵素間の結合部位の探索」
第16回日本蛋白質科学会年会
2016年6月8日(水)福岡国際会議場(福岡県福岡市)

椢原朋子、林勇樹、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatの立体構造解析」
第16回日本蛋白質科学会年会
2016年6月8日(水)福岡国際会議場(福岡県福岡市)

河合秀信、高橋大輔、新井宗仁
「天然タンパク質の立体構造物性に関する統計解析」
第16回日本蛋白質科学会年会
2016年6月8日(水)福岡国際会議場(福岡県福岡市)

末松佑麿、鎌足雄司、林勇樹、新井宗仁
「アルカン合成酵素ADのNMRと分子動力学シミュレーションによるダイナミクス解析」
第16回日本蛋白質科学会年会
2016年6月8日(水)福岡国際会議場(福岡県福岡市)

Hayashi, Y., Nomura, Y., Wada, M., Arai, M.
"Structural analysis of repeat domains in the Gli349 protein"
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第4回全体会議
2016年6月8日(水)長崎大学(長崎県長崎市)

工藤恒、名和良太、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の構造機能解析」
第16回日本蛋白質科学会年会
2016年6月7日(火)福岡国際会議場(福岡県福岡市)

工藤恒、名和良太、林勇樹、渡辺麻衣、池内昌彦、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の構造機能解析とバイオエネルギー生産への応用」
第16回 東京大学生命科学シンポジウム
2016年4月23日(土)東京大学(東京都目黒区)

椢原朋子、林勇樹、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatの立体構造解析」
第16回 東京大学生命科学シンポジウム
2016年4月23日(土)東京大学(東京都目黒区)

Matsuike, D., Tahara, Y.O., Hamaguchi, T., Arai, M., Miyata, M.
"Structural analyses of the Gli123 protein, essential for Mycoplasma mobile gliding"(英語)
第7回OCARINA(複合先端研究機構)国際シンポジウム
2016年3月17日 大阪市立大学(大阪府大阪市)

工藤恒、名和良太、林勇樹、渡辺麻衣、池内昌彦、新井宗仁
「シアノバクテリア由来アルカン合成関連酵素の機能解析及びバイオエネルギー生産への応用」
藍藻の分子生物学2015
2015年11月16日(月)かずさアカデミアホール(千葉県木更津市)

Inatomi, J., Hayashi, Y., Nomura, Y., Kawakita, Y., Yabe, M., Miyata, M., Arai, M.
"Structural analysis of repeat fragments consisting of the gliding protein Gli349 from Mycoplasma mobile"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月15日(火)金沢大学(石川県金沢市)

Kawai, H., Arai, M.
"Statistical analysis on the molecular density of native proteins"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月14日(月)金沢大学(石川県金沢市)

Yuuma Suematsu, Hayashi, Y., Arai, M.
"Structural dynamics of a cyanobacterial alkane-producing enzyme, aldehyde deformylating oxygenase, studied by NMR and MD simulations"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月14日(月)金沢大学(石川県金沢市)

Ohba, Y., Arai, M., Abe, J., Itabashi, T., Nakamura, T., Takahashi, S., Yamauchi, S.
"Relaxation and lineshape analysis for electron paramagnetic resonance of doubly spin-labeled protein with structural distribution"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月14日(月)金沢大学(石川県金沢市)

Chang, M., Hayashi, Y., Arai, M.
"The search for the binding sites between two enzymes essential for cyanobacterial alkane biosynthesis"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月13日(日)金沢大学(石川県金沢市)

Shimba, K., Yasugi, F., Hayashi, Y., Arai, M.
"Residues essential for the alkane producing activity of aldehyde deformylating oxygenase revealed by alanine scanning mutagenesis"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月13日(日)金沢大学(石川県金沢市)

Tashiro, D., Hayashi, Y., Arai, M.
"Herstatin, an antitumor drug candidate, is an intrinsically disordered protein"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月13日(日)金沢大学(石川県金沢市)

Sawada, T., Oka, Y., Watanabe, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"Rational design to improve the pH-sensitive antibody dissociation of FPA, a ligand for antibody purification"(英語)
第53回日本生物物理学会年会
2015年9月13日(日)金沢大学(石川県金沢市)

工藤 恒、名和良太、林勇樹、新井宗仁
「シアノバクテリア由来アルカン合成関連酵素の変異解析」
第16回日本蛋白質科学会年会
2015年6月25日(木)あわぎんホール(徳島県徳島市)

椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatと転写コアクチベーターCBPのKIXドメインとの相互作用」
第16回日本蛋白質科学会年会
2015年6月24日(水)あわぎんホール(徳島県徳島市)

河合秀信、高橋大輔、新井宗仁
「天然タンパク質の分子サイズ特性に関する統計解析」
第16回日本蛋白質科学会年会
2015年6月24日(水)あわぎんホール(徳島県徳島市)

稲富純一、林勇樹、川北祥人、矢部優、宮田真人、新井宗仁
「マイコプラズマGli349タンパク質の立体構造解析」
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第3回全体会議
2015年6月10日(水)金沢商工会議所会館(石川県金沢市)

矢部優、豊永拓真、木下実紀、新井宗仁、浜口祐、今田勝巳、宮田 真人
「Mycoplasma pneumoniae の滑走に必須なP65 タンパク質の構造解析」
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第3回全体会議
2015年6月10日(水)金沢商工会議所会館(石川県金沢市)

Yabe, M., Kinoshita, M., Imada, K., Furukawa, Y., Arai, M., Miyata, M.
「Structural analysis of P65 protein essential for Mycoplasma pneumoniae gliding」(英語)
The 2014 OCARINA Annual International Meeting
2015年3月4日(水)大阪市立大学(大阪市住吉区)

Otosu, T., Ishii, K., Oikawa, H., Arai, M., Takahashi, S., Tahara, T.
"Two-dimensional fluorescence lifetime correlation spectroscopy on the folding mechanism of B domain of protein A"(英語)
Biophysical Society 59th Annual Meeting
2015年2月8日(日)Baltimore Convention Center, Maryland, USA

Oikawa, H., Kamagata, K., Arai, M., Fukasawa, A., Yokota, H., Ide, T., Takahashi, S.
"Development of the line confocal system for the single molecule tracking of fast folding dynamics of proteins"(英語)
Biophysical Society 59th Annual Meeting
2015年2月8日(日)Baltimore Convention Center, Maryland, USA

Kunihara, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"Interaction of the intrinsically disordered HIV-1 Tat protein with the KIX domain of the transcriptional coactivator CBP"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Kudo, H., Mai Watanabe, Ikeuchi, M., Arai, M.
"Toward the construction of the cyanobacterial mutants that produce high amounts of alkanes"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Tashiro, D., Hayashi, Y., Arai, M.
"Structural analysis of the intron-encoded domain of herstatin"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Kawai, H., Takahashi, D., Arai, M.
"Statistical analysis on the molecular size of native proteins"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Sawada, T., Watanabe, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"Mechanism and improvement of pH-sensitive antibody dissociation by FPA, a ligand for antibody purification"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Inatomi, J., Hayashi, Y., Kawakita, Y., Yabe, M., Miyata, M., Arai, M.
"Structural analysis of the gliding protein Gli349 from Mycoplasma mobile"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Yasugi, F., Hayashi, Y., Arai, M.
"Alanine scanning mutagenesis of cyanobacterial aldehyde decarbonylase that synthesizes alkanes"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Hayashi, Y., Arai, M.
"Development of a high-throughput method to evaluate catalytic activity of fatty acyl-ACP reductase"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Arai, M., Yasugi, F.
"Comprehensive mutagenesis reveals residues critical for aldehyde producing activity of acyl-ACP reductase"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Oikawa, H., Kamagata, K., Arai, M., Fukasawa, Y., Yokota, H., Ide, T., Takahashi, S.
"Development of the line confocal system for the single molecule tracking of fast folding dynamics of proteins"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Otosu, T., Ishii, K., Oikawa, H., Arai, M., Takahashi, S., Tahara, T.
"Study of BdpA folding by two-dimensional fluorescence lifetime correlation spectroscopy: Comprehensive analysis of two BdpA mutants"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Ohba, Y., Itabashi, T., Arai, M., Abe, J., Nakamura, T., Takahashi, S., Yamauchi, S.
"An analysis of dynamic electron paramagnetic resonance lineshape for a denaturation process of spin-labeled protein"(英語)
第52回日本生物物理学会年会
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

乙須拓洋、石井邦彦、小井川浩之、新井宗仁、高橋聡、田原太平
「二次元蛍光寿命相関分光法と一分子FRET測定によるBdpAの構造ダイナミクス解析」
第8回分子科学討論会
2014年9月21日(日)広島大学(広島県東広島市)

稲富純一、林勇樹、川北祥人、矢部優、宮田真人、新井宗仁
「X線小角散乱によるマイコプラズマGli349タンパク質のリピート構造の解析」
第14回日本蛋白質科学会年会
2014年6月26日(木)ワークピア横浜(神奈川県横浜市)

八杉文隆、林勇樹、新井宗仁
「アルカンを合成するラン藻由来アルデヒド脱カルボニル化酵素のアラニンスキャン変異解析」
第14回日本蛋白質科学会年会
2014年6月26日(木)ワークピア横浜(神奈川県横浜市)

澤田泰平、渡辺尚大、林勇樹、新井宗仁
「穏やかなpHで抗体を精製するための新規アフィニティーリガンドの開発」
第14回日本蛋白質科学会年会
2014年6月26日(木)ワークピア横浜(神奈川県横浜市)

小井川浩之、鎌形清人、新井宗仁、深澤宏仁、横田浩章、井出徹、高橋聡
「改良したマイクロ秒分解一分子蛍光測定法による蛋白質の高速折り畳みダイナミクスの追跡」
第14回日本蛋白質科学会年会
2014年6月26日(木)ワークピア横浜(神奈川県横浜市)

稲富純一、林勇樹、新井宗仁
「マイコプラズマGli349タンパク質の立体構造解析」
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第2回全体会議
2014年6月16日(月)旭川大雪クリスタルホール(北海道旭川市)

澤田泰平、渡辺尚大、林勇樹、新井宗仁
「穏やかなpHで抗体を精製するための新規アフィニティーリガンドの開発」
第14回東京大学生命科学シンポジウム
2014年4月26日(土)東京大学(東京都文京区)

Takahashi, D., Arai, M.
"Comprehensive analysis of the scaling relationship between the chain length and the molecular size of native proteins"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月30日(水)国立京都国際会館(京都府京都市)

Hayashi, Y., Yasugi, F., Arai, M.
"Toward the development of cysteine-free variants of aldehyde decarbonylase for industrial bioalkane production"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月30日(水)国立京都国際会館(京都府京都市)

Sawada, T., Watanabe, T., Hayashi, Y., Arai, M.
"Development of a novel affinity ligand for purification of antibodies at moderate pH"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月30日(水)国立京都国際会館(京都府京都市)

Otosu, T.(若手奨励賞), Ishii, K., Oikawa, H., Arai, M., Takahashi, S., and Tahara, T.
"Two-dimensional fluorescence lifetime correlation spectroscopy on the conformational dynamics of the unfolded state of BdpA"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月30日(水)国立京都国際会館(京都府京都市)

Inatomi, J., Hayashi, Y., Arai, M.
"Structure and dynamics of the gliding protein Gli349 from Mycoplasma mobile"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月29日(火)国立京都国際会館(京都府京都市)

Oikawa, H., Kamagata, K., Arai, M., Takahashi, S.
"Improvements of the line confocal system for the single molecule tracking of fast folding dynamics of the B domain of protein A"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月29日(火)国立京都国際会館(京都府京都市)

Yasugi, F., Hayashi, Y., Arai, M.
"Alanine scanning mutagenesis of cyanobacterial aldehyde decarbonylase that synthesizes alkanes"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月28日(月)国立京都国際会館(京都府京都市)

Nawa, R., Yasugi, F., Hayashi, Y., Arai, M.
"Comparison of the activities of acyl-ACP reductases from various alkane producing cyanobacteria"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月28日(月)国立京都国際会館(京都府京都市)

Ohba, Y., Itabashi, T., Arai, M., Abe, J., Takahashi, S., Yamauchi, S.
"Dynamics of Spin-labeled Denatured Protein Studied by Multi-frequency electron paramagnetic resonance"(英語)
第51回日本生物物理学会年会
2013年10月28日(月)国立京都国際会館(京都府京都市)

稲富純一、林勇樹、新井宗仁
「マイコプラズマGli349タンパク質の運動ダイナミクス解析」
新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」第1回全体会議
2013年6月28日(金)名古屋大学(愛知県名古屋市)

小井川浩之、鈴木雄太、鎌形清人、新井宗仁、高橋聡
「ライン共焦点顕微鏡による蛋白質折り畳み運動のマイク秒分解一分子蛍光追跡」
第13回日本蛋白質科学会年会
2013年6月12日(水)とりぎん文化会館(鳥取県鳥取市)

阿部淳、新井宗仁、高橋聡、山内清語、大庭裕範
「ESR法によって明らかになった変性状態における小さいタンパク質の構造」
2012年度日本生物物理学会中部支部講演会
2013年2月19日(火)名古屋大学(愛知県名古屋市)

Sodeyama, K., Nakamura, T., Makabe, K., Kunihiro Kuwajima, Arai, M.
"Recognition mechanism of a TAR nucleic acid by HIV-1 Tat, an intrinsically disordered protein"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第6回国際公開シンポジウム
2012年12月5日(水)京都テルサ(京都府京都市)

Arai, M., Dyson, H.J., Wright, P.E.
"Mechanism of coupled folding and binding of intrinsically disordered proteins"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第6回国際公開シンポジウム
2012年12月5日(水)京都テルサ(京都府京都市)

Oikawa, H., Suzuki, Y., Saito, M., Kamagata, K., Arai, M., Takahashi, S.
"Microsecond-resolved traces of protein folding by single-molecule FRET measurements"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第6回国際公開シンポジウム
2012年12月5日(水)京都テルサ(京都府京都市)

阿部淳、新井宗仁、高橋聡、山内清語、大庭裕範
「cwおよびパルスEPRを用いた変性したプロテインAのBドメイン部位の構造解析」
第51回電子スピンサイエンス学会
2012年11月1日(木) 札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Sodeyama, K., Hayashi, Y., Nakamura, T., Makabe, K., Kunihiro Kuwajima, Arai, M.
"Recognition of a TAR nucleic acid by HIV-1 Tat, an intrinsically disordered protein"(英語)
第50回日本生物物理学会年会
2012年9月22日(土)名古屋大学(愛知県名古屋市)

Arai, M., Ferreon, J.C., Wright, P.E.
"Extremely rapid binding of the intrinsically disordered p53 transactivation subdomain with the TAZ2 domain of CBP"(英語)
第50回日本生物物理学会年会
2012年9月22日(土)名古屋大学(愛知県名古屋市)

Oikawa, H., Suzuki, Y., Kamagata, K., Arai, M., Takahashi, S.
"Microsecond-resolved traces of protein folding by single-molecule FRET measurements"(英語)
第50回日本生物物理学会年会
2012年9月22日(土)名古屋大学(愛知県名古屋市)

Abe, J., Arai, M., Takahashi, S., Yamauchi, S., Ohba, Y.
"Local and Global Structural Analysis of Denatured Protein by CW and pulsed ESR"(英語)
第50回日本生物物理学会年会
2012年9月22日(土)名古屋大学(愛知県名古屋市)

阿部淳、新井宗仁、高橋聡、大庭裕範、山内清語
「変性したプロテインAの構造解析:CWとパルスESR法」
第6回分子科学討論会
2012年9月19日(水)東京大学(東京都文京区)

新井宗仁、Ferreon, J.C., Wright, P.E.
「天然変性タンパク質による標的分子認識機構」
新学術領域「揺らぎと生体機能・水和とATP」合同公開シンポジウム「ゆらぎと水 - 生命のエネルギーと機能の分子機構を探る」
2012年9月14日(金)大阪ガーデンパレス(大阪府大阪市)

小井川浩之、鈴木雄太、斉藤雅嵩、鎌形清人、新井宗仁、高橋聡
「マイクロ秒分解一分子蛍光検出による変性タンパク質の高速揺らぎ」
新学術領域「揺らぎと生体機能・水和とATP」合同公開シンポジウム「ゆらぎと水 - 生命のエネルギーと機能の分子機構を探る」
2012年9月14日(金)大阪ガーデンパレス(大阪府大阪市)

袖山浩平、林勇樹、中村敬、真壁幸樹、桑島邦博、新井宗仁
「天然変性タンパク質HIV-1 Tatと核酸分子TARとの相互作用解析」
第12回日本蛋白質科学会年会
2012年6月21日(木)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

小井川浩之、鎌形清人、新井宗仁、飯島一生、芳坂貴弘、高橋聡
「マイクロ秒分解一分子FRET 測定による蛋白質構造変化の追跡」
第12回日本蛋白質科学会年会
2012年6月21日(木)名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)

Arai, M., Watanabe, T., Sodeyama, K.
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の高活性化」(英語)
JSTさきがけ研究領域合同国際シンポジウム「持続する社会を先導する光科学:環境・エネルギー・機能材料」
2012年3月27日(火)慶応大学日吉キャンパス(神奈川県横浜市)

袖山浩平、新井宗仁
"Mechanism of TAR RNA recognition by HIV-1 Tat, an intrinsically disordered protein"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第5回国際公開シンポジウム
2012年1月7日(土)東大寺総合文化センター(奈良県奈良市)

Arai, M., Ferreon, J.C., Wright, P.E.
"Extremely rapid binding of the p53 transactivation subdomain with the TAZ2 domain of CBP"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第5回国際公開シンポジウム
2012年1月7日(土)東大寺総合文化センター(奈良県奈良市)

阿部淳、新井宗仁、大庭裕範、山内清語、高橋聡
「二量子コヒーレンスEPR法による変性したタンパク質の構造解析:プロテインA」
第50回電子スピンサイエンス学会年会
2011年11月16日(水)仙台国際センター(仙台市青葉区)

阿部淳、新井宗仁、大庭裕範、山内清語、高橋聡
「変性状態におけるプロテインAの二量子コヒーレンスESR法を用いた構造解析」
第5回分子科学討論会
2011年9月21日(水)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

Arai, M., Dyson, H.J., Wright, P.E.
"Leu628 of the KIX Domain of CBP is a Key Residue for the Interaction with the MLL Transactivation Domain"
第11回日本蛋白質科学会年会
2011年6月8日(水)ホテル阪急エキスポパーク(大阪府吹田市)

Yokota, A., Takahashi, H., Takenawa, T., Arai, M.
"Probing the roles of conserved arginine-44 of Escherichia coli dihydrofolate reductase in its function and stability by systematic sequence perturbation analysis"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第4回国際公開シンポジウム
2010年11月30日(火)滋賀県立県民交流センター・ピアザ淡海(滋賀県大津市)

Arai, M., Ferreon, J.C., Dyson, H.J., Wright, P.E.
"Protein interactions monitored by NMR: Intrinsically disordered p53 transactivation subdomains interact with the TAZ2 domain of CBP at two sites"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第4回国際公開シンポジウム
2010年11月30日(火)滋賀県立県民交流センター・ピアザ淡海(滋賀県大津市)

Arai, M., Dyson, H.J., Wright, P.E.
"Leu628 of the KIX domain of CBP is a key residue for the interaction with the MLL transactivation domain"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第4回国際公開シンポジウム
2010年11月30日(火)滋賀県立県民交流センター・ピアザ淡海(滋賀県大津市)

Chul Won Lee, Ferreon, J.C., Ferreon, A.C.M., Arai, M., Wright, P.E.
"Graded enhancement of p53 binding to CREB-binding protein (CBP) by multisite phosphorylation"(英語)
新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第4回国際公開シンポジウム
2010年11月30日(火)滋賀県立県民交流センター・ピアザ淡海(滋賀県大津市)

Arai, M., Ferreon, J.C., Dyson, H.J., Wright, P.E.
"Mapping the interactions of the intrinsically disordered p53 transactivation subdomains with the TAZ2 domain of CBP by NMR"
第49回NMR討論会
2010年11月15日(月)タワーホール船堀(東京都江戸川区)

Arai, M., Ferreon, J.C., Dyson, H.J., Wright, P.E.
"Mapping the interactions of the intrinsically disordered p53 transactivation subdomains with the TAZ2 domain of CBP by NMR"(英語)
日本生物物理学会第48回年会
2010年9月22日(水)東北大学(宮城県仙台市)


シンポジウム開催


得平茂樹、新井宗仁、兼崎友、成川礼、渡辺智
ラン藻ゲノム交流会2023
2023年7月1日(土)東京大学(東京都目黒区)

得平茂樹、粟井光一郎、新井宗仁、兼崎友、成川礼
ラン藻ゲノム交流会2022
2022年7月2日(土)東京都立大学(東京都八王子市)

得平茂樹、粟井光一郎、新井宗仁、兼崎友、成川礼
ラン藻ゲノム交流会2021
2021年10月30日(土)東京都立大学(東京都八王子市)

得平茂樹、粟井光一郎、新井宗仁、兼崎友
ラン藻ゲノム交流会2018
2018年6月30日(土)東京大学(東京都目黒区)

得平茂樹、粟井光一郎、新井宗仁、兼崎友
ラン藻ゲノム交流会2017
2017年6月24日(土)東京大学(東京都目黒区)

得平茂樹、粟井光一郎、新井宗仁、兼崎友
ラン藻ゲノム交流会2016
2016年6月25日(土)東京大学(東京都目黒区)

得平茂樹、粟井光一郎、新井宗仁、兼崎友
ラン藻ゲノム交流会2015
2015年7月25日(土)東京大学(東京都目黒区)

新井宗仁、樋口秀男
東京大学 大学院理学系研究科 物理学専攻 A7サブコース 第2回シンポジウム「生物物理の新展開」
2015年4月17日(金)東京大学(東京都文京区)

新井宗仁、浜田大三
第52回日本生物物理学会年会・シンポジウム「Frontiers in physical properties of proteins: challenges by young scientists」
2014年9月27日(土)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)

新井宗仁、樋口秀男
東京大学 大学院理学系研究科 物理学専攻 A7サブコース 第1回シンポジウム「生物物理の新展開」
2014年4月25日(金)東京大学(東京都文京区)

Arai, M., Ikura, T., Inobe, T., Kamagata, K., Makabe, K., Maki, K., Nakamura, T., Okamoto, Y., Oroguchi, T., Takahashi, S., Tomoki P. Terada, Yoda, T.
"International Symposium on Protein Folding and its Biological Significance"(英語)
2013年3月4日(月)〜6日(水)岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)

太田元規、新井宗仁
第11回日本蛋白質科学会年会・国際ワークショップ「Intrinsic Protein Disorder and Post-translational Modifications」(英語)
2011年6月7日(火)ホテル阪急エキスポパーク(大阪府吹田市)

新井宗仁、槇亙介
第10回日本蛋白質科学会年会・ワークショップ「蛋白質のフォールディング研究が拓く新しい生命科学」
2010年6月17日(木)札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)


その他


大岡紘治、新井宗仁
「タンパク質が形をつくる仕組みを正確に予測する理論の開発」
教養学部報 第653号 (2024/4/1) NEW!

Sato, N., Shimamura, H., Aoyama, R., Teranishi, M., Ooka, K., Liu, R., Kotani, K., Yoshimura, M., Hayashi, Y., Suetaka, S., & Arai, M.
"Theoretical design of novel proteins for medical and industrial applications."
Activity Report 2022 (Supercomputer Center, Institute for Solid State Physics, The University of Tokyo), pp. 230-231 (2023)

新井宗仁
「『高校生と大学生のための金曜特別講座』――大学から高校生へのオンライン教育」
大学における社会連携の可能性―教養教育高度化機構シンポジウム2022報告書 36-40 (2023)

Yoshimura, M., Matsumoto, S., Teranishi, M., Shimamura, H., Aoyama, R., Ooka, K., Masuoka, S., Suetaka, S., Sato, N., Hayashi, Y., & Arai, M.
"Computational design of proteins useful for medical and industrial applications."
Activity Report 2021 (Supercomputer Center, Institute for Solid State Physics, The University of Tokyo), pp. 225-226 (2022)

蓮沼誠久、新井宗仁
「特集によせて(特集 藻類バイオマス利用のための新しい生物工学)」
生物工学 99(8), 403 (2021)

Sato, N., Matsumoto, S., Teranishi, M., Iwaya, K., Ooka, K., Yoshimura, M., Suetaka, S., Oka, Y., Hayashi, Y., & Arai, M.
"Rational computational design of proteins toward drug discovery and industrial applications."
Activity Report 2020 (Supercomputer Center, Institute for Solid State Physics, The University of Tokyo), pp. 252-253 (2021)

新井宗仁「ウイルスと生命科学と教育と」
東大駒場友の会会報 第36号 pp.2-3 (2021)

新井宗仁「創造の原動力」
「知のフィールドガイド 生命の根源を見つめる」(東京大学教養学部 編)pp.6-8
白水社 ; 188頁 ; (2020/05/14)
ISBN: 9784560097571

新井宗仁「創造の原動力」
「知のフィールドガイド 異なる声に耳を澄ませる」(東京大学教養学部 編)pp.6-8
白水社 ; 202頁 ; (2020/05/14)
ISBN: 9784560097564

新井宗仁「軽油相当の炭化水素を大量生産可能なシアノバクテリアの創出」
IFO Research Communications 34, 155 (2020)

Arai, M., Komatsuzaki, T., & Nakamura, H.
"Editorial"
Biophysics and Physicobiology 17, 155 (2020)

新井宗仁「金曜特別講座――オンラインによる新たな高大連携教育のかたち」
東京大学教養学部報 第622号 (2020/11/4)

新井宗仁、鳥井寿夫、受田宏之、永井久美子、申惠媛、大岡紘治、季高駿士、佐藤那音
「東大と全国の高校生をつなぎ続けてはや19年 駒場の魂が脈打つ『金曜特別講座』」(インタビュー記事)
学内広報 1538, 1-3 (2020/9/24)

佐藤宏樹、児玉彩、工藤恒、大岡紘治、季高駿士、林勇樹、新井宗仁、宮田真人
Mycoplasma mobileのモーターを構成するタンパク質MMOB1620の構造解析」
Photon Factory Activity Report 2019 37, 108 (2020)

Ohara, K., Sano, M., Suetaka, S., Sato, N., Oka, Y., Ooka, K., Hayashi, Y., & Arai, M..
"Computational design of enzymes and ligand-binding proteins."
Activity Report 2019 (Supercomputer Center, Institute for Solid State Physics, The University of Tokyo), pp. 252-253 (2020)

新井宗仁「抗ウイルス薬開発の鍵はプロテイン『生命の根源を見つめる』」
じんぶん堂(朝日新聞社の人文書籍情報サイト)(2020/05)

新井宗仁「送る言葉『陶山明先生を送る』」
東京大学教養学部報 第616号 (2020/2/3)

張マリ、工藤恒、大岡紘治、季高駿士、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の複合体構造のSAXS解析」
Photon Factory Activity Report 2018 36, 235 (2019)

新井宗仁「タンパク質のフォールディングとデザイン」
Frontiere 2018(東京大学大学院総合文化研究科 広域科学専攻年報) pp.6-7 (2019)

新井宗仁「生物学の難問に物理学で立ち向かう、タンパク質の物性研究」(インタビュー記事)
キミの東大 高校生・受験生が東京大学をもっと知るためのサイト (2018)

新井宗仁「『知のフィールドガイド』への招待」
webふらんす 東京大学教養学部編〈知のフィールドガイド〉特集 (2018)

河合秀信「第57回生物物理若手の会夏の学校 ―躍進する生物物理とその発展―」
日本物理学会誌 73(4), 247-248 (2018)

工藤恒「若手の会だより 〜学振セミナーに講師として参加して〜」
生物物理 58(3), 173-174 (2018)

工藤恒、張マリ、河合秀信、岡芳樹、和田愛未、季高駿士、大岡紘治、末松佑麿、吉崎慧、林勇樹、新井宗仁
「ラン藻由来アルカン合成関連酵素の立体構造解析」
Photon Factory Activity Report 2017 35, 284 (2018)

Suematsu, Y., & Arai, M..
"Conformational dynamics of proteins studied by molecular dynamics simulations."
Activity Report 2017 (Supercomputer Center, Institute for Solid State Physics, The University of Tokyo), pp. 292-293 (2018)

工藤恒「若手の会だより 第57回生物物理若手の会夏の学校開催報告」
生物物理 57(6), 327-328 (2017)

椢原朋子、田代大祐、林勇樹、工藤恒、河合秀信、岡芳樹、張マリ、和田愛未、新井宗仁
「X線溶液散乱法による天然変性タンパク質の立体構造解析」
Photon Factory Activity Report 2016 34, 297 (2017)

林勇樹、野村芳弘、和田愛未、浜口祐、高森綾、宮田真人、新井宗仁
「マイコプラズマ滑走タンパク質Gli349の立体構造解析」
Photon Factory Activity Report 2016 34, 306 (2017)

新井宗仁「天然変性蛋白質による標的分子認識機構の解明」
旭硝子財団 助成研究成果報告書 (2017/07)

新井宗仁「受賞報告:新井グループの岡芳樹君が第17 回日本蛋白質科学会年会でポスター賞を受賞」
『柔らかな分子系』ニュースレター No. 47、pp.394 (2017/07)

Suematsu, Y., & Arai, M..
"Structural dynamics of an aldehyde-deformylating oxygenase studied by molecular dynamics simulations."
Activity Report 2016 (Supercomputer Center, Institute for Solid State Physics, The University of Tokyo), pp. 257-257 (2017)

高橋聡、新井宗仁、大上雅史、広瀬恵子
「日本生物物理学会第54回年会報告 日本生物物理学会学生発表賞 ―第1回選考過程報告―」
生物物理 57(3), 159-160 (2017)

新井宗仁、太田邦史「大隅良典先生ノーベル賞受賞記念講演会の報告」
東京大学教養学部報 第592号 (2017/5/2)

新井宗仁「<施設・組織紹介>初年次活動センターを活用しましょう」
東京大学教養学部報 第591号 (2017/4/1)

工藤恒「若手の会だより 〜第57回生物物理若手の会 夏の学校 関東支部開催〜」
生物物理 57(2), 115-116 (2017)

新井宗仁「2016年度防災訓練報告」
東京大学教養学部報 第590号 (2017/2/1)

新井宗仁「受賞報告:A03 新井グループの末松佑麿君が第54回 日本生物物理学会年会において学生発表賞を受賞しました」
『柔らかな分子系』ニュースレター No. 41、pp.333 (2017/01)

新井宗仁「受賞報告:A03 新井グループの河合秀信君が第54回 日本生物物理学会年会において学生発表賞を受賞しました」
『柔らかな分子系』ニュースレター No. 41、pp.332 (2017/01)

新井宗仁「受賞報告:A03 新井グループの和田愛未君が第54回 日本生物物理学会年会において学生発表賞を受賞しました」
『柔らかな分子系』ニュースレター No. 41、pp.331 (2017/01)

新井宗仁「受賞報告:A03 新井グループの工藤恒君が第54回 日本生物物理学会年会において学生発表賞を受賞しました」
『柔らかな分子系』ニュースレター No. 41、pp.330 (2017/01)

工藤恒「若手の会だより 第57回生物物理若手の会夏の学校開催報告」
生物物理 57(6), 327-328 (2017)

高橋聡、新井宗仁、大上雅史、広瀬恵子
「日本生物物理学会第54回年会報告 日本生物物理学会学生発表賞 ―第1回選考過程報告―」
生物物理 57(3), 159-160 (2017)

工藤恒「若手の会だより 〜第57回生物物理若手の会 夏の学校 関東支部開催〜」
生物物理 57(2), 115-116 (2017)

新井宗仁「高校生のためのオープンキャンパス2016報告」
東京大学教養学部報 第586号 (2016/10/4)

岡芳樹「若手の会だより 〜分科会オーガナイザーを経験して〜」
生物物理 56(5), 296-297 (2016)

工藤恒「藻類でエネルギーをつくる!」
実験医学 34(14), p.2383, 羊土社 (2016)

岡芳樹「若手の会だより 〜分科会オーガナイザーを経験して〜」
生物物理 56(5), 296-297 (2016)

工藤恒「若手の会だより 〜キャリアパスセミナーに参加して〜」
生物物理 55(5), 276-277 (2015)

稲富純一、林勇樹、川北祥人、矢部優、宮田真人、新井宗仁
「X線溶液散乱法によるマイコプラズマ滑走タンパク質Gli349 の立体構造解析」
Photon Factory Activity Report 2014 32, B 168 (2015)

小井川浩之、鎌形清人、新井宗仁、高橋 聡
「業績紹介:高速一分子蛍光計測により明らかにしたBdpAのフォールディング運動の複雑さ」
『柔らかな分子系』ニュースレター No. 21、pp.125 (2015/05/27)

工藤恒「若手の会だより 〜キャリアパスセミナーに参加して〜」
生物物理 55(5), 276-277 (2015)

新井宗仁「天然変性蛋白質による分子認識の物理化学的基盤」
倉田奨励金研究報告 第44集、pp.1-2 (2014/10/20)

新井宗仁「天然変性蛋白質による分子認識の物理化学的基盤」
倉田奨励金研究報告 第43集、pp.17-18 (2013/10/25)

新井宗仁「恩師・桑島先生」
桑島邦博教授・退職記念誌、pp.194-198 (2013/3/4)

新井宗仁「天然変性蛋白質による分子認識の物理化学的基盤」
倉田奨励金研究報告 第42集、pp.48-49 (2012/10/25)

新井宗仁「『揺らぎと生体機能』平成24年度合同班会議報告」
『揺らぎと生体機能』ニュースレター No. 45、pp.6-7 (2012/8/27)

新井宗仁「バイオエネルギーをつくる」
東京大学教養学部報 第546号 (2012/3/27)

新井宗仁「業績紹介:天然変性蛋白質の多様な相互作用をNMR 法で定量的に調べる」
『揺らぎと生体機能』ニュースレター No. 40、pp.1 (2012/3/26)

新井宗仁「シンポジウム報告:4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences - Experiments and Simulations」
『揺らぎと生体機能』ニュースレター No. 38、pp.7 (2012/1/26)

新井宗仁「シンポジウム報告:International Workshop "Intrinsic Protein Disorder and Post-Translational Modifications" (PSSJ2011)」
『揺らぎと生体機能』ニュースレター No. 32、pp.14 (2011/7/26)

新井宗仁「業績紹介:ジヒドロ葉酸還元酵素はマイクロ秒時間域においてサブドメインごとにフォールディングする」
『揺らぎと生体機能』ニュースレター No. 32、pp.2 (2011/7/26)

新井宗仁「業績紹介: p53の天然変性領域における多重リン酸化の役割」
『揺らぎと生体機能』ニュースレター No. 25、pp.7 (2010/12/28)

新井宗仁「業績紹介: KIX蛋白質の構造揺らぎを制御するアミノ酸残基」
『揺らぎと生体機能』ニュースレター No. 25、pp.6 (2010/12/28)

新井宗仁「<時に沿って> 初心にかえる」
東京大学教養学部報 第532号 (2010/10/6)


2010年3月以前


原著論文


Yokota, A., Takahashi, H., Takenawa, T., & Arai, M.
Probing the roles of conserved arginine-44 of Escherichia coli dihydrofolate reductase in its function and stability by systematic sequence perturbation analysis.
Biochem. Biophys. Res. Commun. 391(4), 1703-1707 (2010)

Ferreon, J.C., Lee, C.W., Arai, M., Martinez-Yamout, M.A., Dyson, H.J., & Wright, P.E.
Cooperative regulation of p53 by modulation of ternary complex formation with CBP/p300 and HDM2.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106(16), 6591-6596 (2009)

Lee, C.W., Arai, M., Martinez-Yamout, M.A., Dyson, H.J., & Wright, P.E.
Mapping the interactions of the p53 transactivation domain with the KIX domain of CBP.
Biochemistry 48(10), 2115-2124 (2009)

Inobe, T., Takahashi, K., Maki, K., Enoki, S., Kamagata, K., Kadooka, A., Arai, M., & Kuwajima, K.
Asymmetry of the GroEL-GroES complex under physiological conditions as revealed by small-angle x-ray scattering.
Biophys. J. 94(4), 1392-1402 (2008)

Arai, M., Kondrashkina, E., Kayatekin, C., Matthews, C.R., Iwakura, M., & Bilsel, O.
Microsecond hydrophobic collapse in the folding of Escherichia coli dihydrofolate deductase, an α/β-type protein.
J. Mol. Biol. 368(1), 219-229 (2007)

Takahashi, H., Arai, M., Takenawa, T., Sota, H., Xie, Q.H., & Iwakura, M.
Stabilization of hyperactive dihydrofolate reductase by cyanocysteine-mediated backbone cyclization.
J. Biol. Chem. 282(13), 9420-9429 (2007)

Arai, M., & Iwakura, M.
Peptide fragment studies on the folding elements of dihydrofolate reductase from Escherichia coli
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics 62(2), 399-410 (2006)

Yamada, Y., Yajima, T., Fujiwara, K., Arai, M., Ito, K., Shimizu, A., Kihara, H., Kuwajima, K., Amemiya, Y., & Ikeguchi, M.
Helical and expanded conformation of equine β-lactoglobulin in the cold-denatured state.
J. Mol. Biol. 350(2), 338-348 (2005)

Nakao, M., Maki, K., Arai, M., Koshiba, T., Nitta, K., & Kuwajima, K.
Characterization of kinetic folding intermediates of recombinant canine milk lysozyme by stopped-flow circular dichroism.
Biochemistry 44(17), 6685-6692 (2005)

Arai, M., & Iwakura, M.
Probing the interactions between the folding elements early in the folding of Escherichia coli dihydrofolate reductase by systematic sequence perturbation analysis.
J. Mol. Biol. 347(2), 337-353 (2005)

Akhtar, M. W., Srinivas, V., Raman, B., Ramakrishna, T., Inobe, T., Maki, K., Arai, M., Kuwajima, K., & Rao, C. M.
Oligomeric Hsp33 with enhanced chaperone activity: gel-filtration, cross-linking and SAXS analysis.
J. Biol. Chem. 279(53), 55760-55769 (2004)

Saeki#, K., Arai#, M., Yoda, T., Nakao, M., & Kuwajima, K. (# equal contribution)
Localized nature of the transition-state structure in goat α-lactalbumin folding.
J. Mol. Biol. 341(2), 589-604 (2004)

Kamagata, K., Arai, M., & Kuwajima, K.
Unification of the folding mechanisms of non-two-state and two-state proteins.
J. Mol. Biol. 339(4), 951-965 (2004) [erratum]

Ali, S.A., Iwabuchi, N., Matsui, T., Hirota, K., Kidokoro, S., Arai, M., Kuwajima, K., Schuck, P., & Arisaka, F.
Reversible and fast association equilibria of a molecular chaperone, gp57A, of bacteriophage T4.
Biophys. J. 85(4), 2606-2618 (2003)

Arai, M., Kataoka, M., Kuwajima, K., Matthews, C.R., & Iwakura, M.
Effects of the difference in the unfolded-state ensemble on the folding of Escherichia coli dihydrofolate reductase.
J. Mol. Biol. 329(4), 779-791 (2003)

Inobe, T., Kikushima, K., Makio, T., Arai, M., & Kuwajima, K.
The allosteric transition of GroEL induced by metal fluoride-ADP complexes.
J. Mol. Biol. 329(1), 121-134 (2003)

Nakao, M., Arai, M., Koshiba, T., Nitta, K., & Kuwajima, K.
Folding mechanism of canine milk lysozyme studied by circular dichroism and fluorescence spectroscopy.
Journal of Spectroscopy 17, 184135 (2003)

Arai, M., Maki, K., Takahashi, H., & Iwakura, M.
Testing the relationship between foldability and the early folding events of dihydrofolate reductase from Escherichia coli.
J. Mol. Biol. 328(1), 273-288 (2003)

Arai, M., Inobe, T., Maki, K., Ikura, T., Kihara, H., Amemiya, Y., & Kuwajima, K.
Denaturation and reassembly of chaperonin GroEL studied by solution X-ray scattering.
Protein Sci. 12(4), 672-680 (2003)

Inobe, T., Arai, M., Nakao, M., Ito, K., Kamagata, K., Makio, T., Amemiya, Y., Kihara, H., & Kuwajima, K.
Equilibrium and kinetics of the allosteric transition of GroEL studied by solution X-ray scattering and fluorescence spectroscopy.
J. Mol. Biol. 327(1), 183-191 (2003)

Kuwajima, K., Arai, M., Inobe, T., Ito, K., Nakao, M., Maki, K., Kamagata, K., Kihara, H., & Amemiya, Y.
The use of the time-resolved X-ray solution scattering for studies of globular proteins.
Journal of Spectroscopy 16, 428646 (2002)

Arai, M., Ito, K., Inobe, T., Nakao, M., Maki, K., Kamagata, K., Kihara, H., Amemiya, Y., & Kuwajima, K.
Fast compaction of α-lactalbumin during folding studied by stopped-flow X-ray scattering.
J. Mol. Biol. 321(1), 121-132 (2002)

Qin, Z., Hu, D., Shimada, L., Nakagawa, T., Arai, M., Zhou, J.M., & Kihara, H.
Refolding of β-lactoglobulin studied by stopped-flow circular dichroism at subzero temperatures.
FEBS Lett. 507(3), 299-302 (2001)

Yoda, T., Saito, M., Arai, M., Horii, K., Tsumoto, K., Matsushima, M., Kumagai, I., & Kuwajima, K.
Folding-unfolding of goat α-lactalbumin studied by stopped-flow circular dichroism and molecular dynamics simulations.
Proteins: Structure, Function and Genetics 42(1), 49-65 (2001)

Chaudhuri, T.K., Arai, M., Terada, T.P., Ikura, T., & Kuwajima, K.
Equilibrium and kinetic studies on folding of the authentic and recombinant forms of human α-lactalbumin by circular dichroism spectroscopy.
Biochemistry 39(50), 15643-15651 (2000)

Fukuda, H., Arai, M., & Kuwajima, K.
The folding of green fluorescent protein and the Cycle3 mutant.
Biochemistry 39(39), 12025-12032 (2000)

Arai, M., Hamel, P., Kanaya, E., Inaka, K., Miki, K., Kikuchi, M., & Kuwajima, K.
Effect of an alternative disulfide bond on the structure, stability, and folding of human lysozyme.
Biochemistry 39(12), 3472-3479 (2000)

Forge, V., Hoshino, M., Kuwata, K., Arai, M., Kuwajima, K., & Goto, Y.
Is folding of β-lactglobulin non-hierarchic? Intermediate with native-like β-sheet and non-native α-helix.
J. Mol. Biol. 296(4), 1039-1051 (2000)

Makio, T., Arai, M., & Kuwajima, K.
Chaperonin-affected refolding of α-lactalbumin. Effects of nucleotides and the co-chaperonin GroES.
J. Mol. Biol. 293(1), 125-137 (1999)

Fujiwara, K., Arai, M., Shimizu, A., Ikeguchi, M., Kuwajima, K., & Sugai, S.
Folding-unfolding equilibrium and kinetics of equine β-lactoglobulin: equivalence between the equilibrium molten globule state and a burst phase folding intermediate.
Biochemistry 38(14), 4455-4463 (1999)

Chaudhuri, T.K., Horii, K., Yoda, T., Arai, M., Nagata, S., Terada, T.P., Ikura, T., Uchiyama, H., Tsumoto, K., Kataoka, H., Matsushima, M., Kuwajima, K., & Kumagai, I.
Effect of the extra N-terminal methionine residue on the stability and folding of recombinant α-lactalbumin expressed in Escherichia coli.
J. Mol. Biol. 285(3), 1179-1194 (1999)

Mizuguchi, M., Arai, M., Ke, Y., Nitta, K., & Kuwajima, K.
Equilibrium and kinetics of the folding of equine lysozyme studied by circular dichroism spectroscopy.
J. Mol. Biol. 283(1), 265-277 (1998)

Arai, M., Ikura, T., Semisotnov, G.V., Amemiya, Y., Kihara, H., & Kuwajima, K.
Kinetic refolding of β-lactoglobulin. Studies by synchrotron X-ray scattering, and circular dichroism, absorption and fluorescence spectroscopy.
J. Mol. Biol. 275(1), 149-162 (1998)

Arai, M., & Kuwajima, K.
Rapid formation of a molten globule intermediate in refolding of α-lactalbumin.
Folding & Design 1(4), 275-287 (1996)


総説


Kuwajima, K., Inobe, T., & Arai, M.
The allosteric transition of the chaperonin GroEL from Escherichia coli studied by solution X-ray scattering.
Macromolecular Res. 14(2), 166-172 (2006)

Arai, M., & Iwakura, M.
タンパク質のフォールディング・エレメント
生物物理 45(3), 140-144 (2005)

Kuwajima, K., & Arai, M.
[Two views of protein folding: what is the universal view? ] (Japanese)
Tanpakushitsu Kakusan Koso 47(6), 657-662 (2002)

Kuwajima, K., & Arai, M.
The molten globule state: the physical picture and biological significance.
In Mechanisms of Protein Folding (Second Edition) (Pain, R.H. ed), (2000) Oxford University Press, New York.

Arai, M., & Kuwajima, K.
Role of the molten globule state in protein folding.
Adv. Protein Chem. 53, 209-282 (2000)


著書


      

新井宗仁
タンパク質の溶媒変化による変性(変性剤変性、pH変性、熱変性)
「タンパク質科学」(後藤祐児、桑島邦博、谷澤克行・監修)pp. 185-195
化学同人 ; 579頁 ; ISBN-10: 4759810471 ; (2005/10)

      

Arai, M., Ito, K., Maki, K., Ikura, T., Inobe, T., Kihara, H., Amemiya, Y., & Kuwajima, K.
Structural analysis of protein folding intermediates by solution X-ray scattering.
In Old and New Views of Protein Folding (Kuwajima, K. & Arai, M. eds) pp. 31-40, (1999) Elsevier Science, Amsterdam.

Kuwajima, K., Arai, M., Mizuguchi, M., Koshiba, T., & Nitta, K.
The folding mechanisms of α-lactalbumin and Ca2+-binding lysozyme.
In Old and New Views of Protein Folding (Kuwajima, K. & Arai, M. eds) pp. 135-144, (1999) Elsevier Science, Amsterdam.

Yoda, T., Saito, M., Arai, M., Horii, K., Tsumoto, K., Matsushima, M., Kumagai, I., Chaudhuri, T.K., & Kuwajima, K.
Kinetic folding reactions and molecular dynamics simulations of α-lactalbumin.
In Old and New Views of Protein Folding (Kuwajima, K., Arai, M. eds) pp. 155-162, (1999) Elsevier Science, Amsterdam.


編集、翻訳等


「物理生化学」
田之倉優、有坂文雄(監訳)
田之倉優、有坂文雄、新井宗仁、小島 正樹、佐々木 宏、鈴木 倫太郎、武田 茂樹、奈良 雅之、秦野 賢一(翻訳)
医学出版 ; A5判 750頁 ; ISBN-10: 4757804032 ; (2003/05/25)
(原著:"Principles of Physical Biochemistry", Kensal E. Van Holde, et al.)

"Old and New Views of Protein Folding"
Kuwajima, K., & Arai, M. (Editors)
Elsevier Science Ltd ; ISBN-10: 0444502912 ; (1999/11/30)


特許


新井宗仁、巖倉正寛
「蛍光強度解析法」
特許第4883411号(特願2007-059910)出願日:平成19年3月9日、登録日:平成23年12月16日


 


Abstractは、PubMedへの外部リンクです。
* Corresponding author