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ソフトウェア

Rare Codon Analysis ESPRESSO (Solubility) Protein Calculator (charge)
ColabFold (Structure prediction) Agadir (helix prediction) PyMOL (drawer)
QuikChange primer design Primer Tm (sigma-aldrich) BLAST (seq search)
Clustal Omega (seq align) Clustal W/X (seq align) molmol (drawer)
DISOPRED (IDP) NMRView (NMR analysis) PairCoil (coiled-coil 2mer)
PONDR (IDP) NMRPipe (NMR analysis) MultiCoil (coiled-coil n-mer)
POODLE (IDP) Contact order (Baker lab) FoldX (protein stability)
Rosetta (Baker lab) Foldit (Baker lab) GLOVE (NMR R2 dispersion)
SeqScanner (DNA sequencing) ATSAS (SAXS, EMBL) SAngler (SAXS, KEK-PF)
BioEdit (seq analysis) Discovery Studio Visualizer (drawer)


データベース

PubMed PDB (Protein Structure) AlphaFold DB (Protein structure)
Web of Science SCOP (Protein Structure) DisProt (IDP)
Journal Citation Reports SCOPe (Protein Structure) Pfam (Protein family)
CATH (Protein Structure) DBGET (GenomeNET)


雑誌

ScienceDirect Proc. Natl. Acad. Sci. USA Proteins
Nature J. Am. Chem. Soc. Protein Sci.
Science EMBO J. Protein Eng. Des. Sel.
Cell J. Mol. Biol. Structure
Mol. Cell J. Biol. Chem. Biophys. J.
Nature Struct. Mol. Biol. Biochemistry Biochem Biophys Res Comm
Nature Biotechnology FEBS Lett. J. Biochem.
Nature Chem. Biol. FEBS J. J. Biochem. (1922-2004)
Nature Communications Scientific Reports J. Biomol. NMR
PLoS ONE Biophysics and Physicobiology Biotechnology for Biofuels
Biophysical Reviews


学会等

Protein Society 日本生物物理学会 日本蛋白質科学会
Biophysical Society 日本生化学会 NMR討論会
日本生物工学会 日本物理学会 日本農芸化学会
よこはまNMR研究会 構造エピゲノム研究会 PRC ニュースレター
新学術領域「運動マシナリー」 新学術領域「柔らかな分子系」 新学術領域「揺らぎと生体機能」
PEP TALK JST「藻類バイオエネルギー」


研究者(敬称略)

Wright, P. E. (Scripps) 高橋 聡 (東北大) 笹井理生 (名古屋大)
Dyson, H. J. (Scripps) 後藤祐児 (大阪大) 本田真也 (産総研)
Matthews, C. R. (U Mass) 津本浩平 (東大) 槇 亙介 (名古屋大)
Bilsel, Osman (U Mass) 水口峰之 (富山大) 竹内 恒(東大)
Baker, David (U Washington) 田口英樹 (東工大) 伊野部智由(富山大)


その他

東大駒場生協 東大附属図書館(EZproxy) 東大ポータル(学外から)
助成財団センター 科研費(文部科学省) 科研費(日本学術振興会)
e-Rad(研究費申請) J-GLOBAL(研究者・文献DB) Researchmap(研究者DB)
東大電力マップ UTAS(東大学務システム) JREC-IN(研究者人材DB)
高エネ研 Photon Factory 高エネ研 共同利用支援システム